期刊文章详细信息
睡莲WRKY家族的全基因组鉴定和分子进化分析
Genomic Identification and Molecular Evolution of the WRKY Family in Nymphaea colorata
文献类型:期刊文章
PAN Xinfeng;YE Fangting;MAO Zhijun;LI Zhaowei;FAN Kai(Key Laboratory of Ministry of Education for Genetics,Breeding and Multiple Utilzation of Crops,College of Agriculture,Fujian Agriculture And Forestry University,Fuzhou 350002,China)
机构地区:[1]福建农林大学农学院,作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室,福州350002
基 金:国家自然科学基金项目(31701470);中国博士后基金项目(2017M610388;2018T110637);福建农林大学杰出青年科研人才计划项目(xjq201917);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2020007A);福建省自然科学基金项目(2021J01073)。
年 份:2022
卷 号:49
期 号:5
起止页码:1121-1135
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:在睡莲中共鉴定出69个NcWRKY转录因子,将其分成3个亚家族,即Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ,其中Ⅱ亚家族可进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe,与拟南芥中WRKY亚家族分类相同。Ⅱc亚家族中含有17个成员,是睡莲WRKY家族中成员数最多的亚家族。所有成员的蛋白质二级结构中无规则卷曲所占比例高达为39%~78%。motif 1和motif 3被注释为WRKY保守结构。NcWRKY成员在睡莲14条染色体中均有分布,其中Ⅱa亚家族中所有成员都定位在Nc4号染色体。启动子顺式调控元件分析发现,NcWRKY成员广泛参与激素调控反应,通过不同组织中表达量分析筛选出在成熟叶柄中高表达的NcWRKY04与NcWRKY18,在花瓣中高表达的NcWRKY05和在雄蕊中高表达的NcWRKY61。基因复制事件分析发现,NcWRKY家族主要以片段复制事件为主。基因表达网络关系分析预测NcWRKY61和NcWRKY63可能与其他成员有共表达关系。
关 键 词:睡莲 WRKY 全基因组鉴定 分子进化
分 类 号:S682.32]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...