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期刊文章详细信息

广西辣椒病毒的sRNA深度测序和RT-PCR鉴定    

Identification of Viruses Infecting Peppers in Guangxi by Small RNA Deep Sequencing and RT-PCR

  

文献类型:期刊文章

作  者:龚明霞[1] 赵虎[1] 王萌[1] 吴星[1] 赵曾菁[1] 何志[1] 黄金梅[1] 孟生德[2] 王日升[1]

GONG Mingxia;ZHAO Hu;WANG Meng;WU Xing;ZHAO Zengjing;HE Zhi;HUANG Jinmei;MENG Shengde;WANG Risheng(Guangxi Key Laboratory of Vegetable Breeding and New Technology Development,Vegetable Research Institute,Guangxi Academy of Agricultural Sciences,Nanning 530007,China;Gansu Dunhuang Seed Industry Group Co.Ltd,Jiuquan,Gansu 735008,China)

机构地区:[1]广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所,广西蔬菜育种与新技术研究重点实验室,南宁530007 [2]甘肃省敦煌种业集团股份有限公司,甘肃酒泉735008

出  处:《园艺学报》

基  金:国家自然科学基金项目(32060687);广西科技重大专项(桂科AA17204026);广西自然科学基金项目(2019 GXNSFAA 185039);广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2019M30)。

年  份:2022

卷  号:49

期  号:5

起止页码:1060-1072

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:采用小RNA(sRNA)深度测序技术,结合RT-PCR技术对广西9个辣椒主产区具有典型病毒病症状的病样进行检测,共发现10种病毒,其中小米椒内源RNA病毒1(Capsicum frutescens endornavirus 1,CFEV 1)、辣椒潜隐病毒2(pepper cryptic virus 2,PCV 2)、烟草轻型绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)和辣椒黄脉病毒(pepper vein yellows virus,PeVYV)是在广西辣椒上首次发现,且CFEV 1在中国是首次发现。10种病毒在75份辣椒病样中的总检出率为8.00%~66.67%,前5位依次为辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV,66.67%)、甜椒脉斑驳病毒(pepper veinal mottle virus,PVMV,62.67%)、黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV,41.33%)、CFEV 1(32.0%)以及PCV 2(26.67%)。ChiVMV、PVMV、CMV和CFEV 1在广西7~9个辣椒主产区广泛分布,推测为优势病毒。除桂林外,其他8个辣椒主产区均含以上4种优势病毒中的1~3种,但在桂林,这4种病毒的检出率偏低或检不出,其优势病毒种类是PMMoV和PCV 2。广西辣椒病毒病复合侵染率为94.66%,3种(检出率42.67%)和4种(检出率24.00%)病毒复合侵染是主要形式。3种复合侵染中以ChiVMV+PVMV+CMV和ChiVMV+CFEV 1+ChiRSV占比最高(均为18.75%),4种复合侵染中以ChiVMV+PVMV+CMV+CFEV 1占比最高(16.67%)。

关 键 词:辣椒 病毒病 小RNA 深度测序  RT-PCR  分子鉴定

分 类 号:S641.3]

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