文献类型：期刊文章

作　　者：翁婷婷[1] 王乐颖[1] 李海燕[1] 梁春婵[1] 刘振伟[2] 董琳[1]

Weng Tingting;Wang Leying;Li Haiyan;Liang Chunchan;Liu Zhenwei;Dong Lin

机构地区：[1]温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院儿童呼吸科,温州325027 [2]温州医科大学基因组医学研究院,温州325025

出　　处：《中华微生物学和免疫学杂志》

基　　金：浙江省基础公益技术研究计划项目(LGF20H010004);温州市基础性科研项目(Y20190437);温州医科大学附属第二医院、育英儿童医院贺林院士工作站科研基金重点项目(18331103)。

年　　份：2022

卷　　号：42

期　　号：5

起止页码：396-403

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的通过RNA测序(RNA-sequencing,RNA-seq)获取表达数据,并通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选与呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)毛细支气管炎患儿疾病严重程度相关的核心基因,为预测RSV感染病情提供参考。方法将2019年10月1日—2020年2月29日在温州医科大学附属第二医院住院的22例RSV毛细支气管炎患儿作为病例组,根据病情分为轻度组、中度组及重度组,以22例健康儿童作为对照组,收集全血白细胞总RNA进行RNA-seq,比较不同严重程度患儿与对照组的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),寻找与疾病严重程度相关的基因共表达模块,筛选能评估疾病严重程度的生物学指标。结果22例患儿中位年龄3个月,男19例,女3例,对照组中位年龄4个月,男14例,女8例,两组年龄及性别差异无统计学意义。轻度组8例,中度组和重度组各7例。通过显著性分析发现轻度组有416个DEGs,中度组有586个,重度组有846个。根据WGCNA分析发现10个共表达模块,其中棕色模块与疾病严重程度存在明显相关性(r=0.62,P<0.001)。进一步对棕色模块中的DEGs进行蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建并根据基因节点的连接度筛选出前30个核心基因,其中关联度较大的为基因RBX1和PSMA7。RBX1、PSMA7基因在重度组中表达上调,在轻、中度组中的表达与对照组比较差异无统计学意义。结论RBX1和PSMA7基因可能是RSV毛细支气管炎疾病严重度的生物学预测指标。

关 键 词：RNA测序  加权基因共表达网络分析  呼吸道合胞病毒 毛细支气管炎 疾病严重程度

分 类 号：R725.6]