期刊文章详细信息
一起宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学检测及分子溯源
Pathogenic detection and molecular tracing of a bacillary dysentery outbreak by Shigella sonnei in Huainan city
文献类型:期刊文章
Liu Jiang;Sun Yong;Zhang Jie;Zeng Fanrong;Wang Xiaobo;Zhu Lijie;Sun Mengyang;Yu Shoujie(Microbiological Laboratory,Huainan City Center for Disease Control and Prevention,Huainan 232033,China;Microbiological laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention,Hefei 230601,China)
机构地区:[1]淮南市疾病预防控制中心微生物检验科,淮南232033 [2]安徽省疾病预防控制中心微生物检验科,合肥230601
基 金:“十三五”重大传染病防治项目 (2018ZX10713003-002-005)。
年 份:2022
卷 号:56
期 号:4
起止页码:437-442
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋内志贺菌进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果56份黏稀样粪便分离出38株宋内志贺菌(阳性率67.86%),血清型均为宋内志贺菌Ⅰ相;3份末梢水和井水革兰阴性菌(GN)增菌液荧光PCR检测志贺菌阳性;菌株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H(ipaH)阳性(38份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)阳性(31份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)/肠毒素2基因(sen)阳性(1份);耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药,仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物;36株菌XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致,其中3株菌株基因组ST型分析均为ST152型;全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌株引起,且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌株、1株韩国菌株聚集成一个大簇,而与其他国家的菌株距离较远。结论本起由水源污染单一宋内志贺菌克隆引起,分离株为低毒力株,呈多重耐药表型。
关 键 词:宋内志贺菌 全基因组测序 聚合酶链反应 药敏试验
分 类 号:R516.4] R446.5[临床医学类]
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