期刊文章详细信息
基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of differentially expressed lncRNA in human ovarian cancer cells treated with ghrelin based on next-generation sequencing
文献类型:期刊文章
Wan-ying Song;Ri-gai Sa;Hai-ning Gao;Peng-wei Zhao(Department of Clinical Laboratory,Xinganmeng Peoples'Hospital,Ulanhot,Inner Mongolia 137400,China;Inner Mongolia Medical University,Hohhot,Inner Mongolia 010059,China;Department of Pathogenic and Immunology,School of Basic Medical Science,Inner Mongolia Medical University,Hohhot,Inner Mongolia 010059,China)
机构地区:[1]兴安盟人民医院,内蒙古乌兰浩特137400 [2]内蒙古医科大学,内蒙古呼和浩特010059 [3]内蒙古医科大学基础医学院微生物与免疫学研究室,内蒙古呼和浩特010059
年 份:2022
卷 号:32
期 号:9
起止页码:25-31
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的分析二代测序技术ghrelin作用后的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达。方法从对照组(不添加ghrelin)和实验组(添加600 ng/mL ghrelin 24 h)的人卵巢癌细胞株SKOV-3中分别提取RNA进行测序,筛选出实验组发生差异表达的lncRNA,对其进行靶基因预测并将预测结果与差异mRNA取交集,对取交集后的基因进行GO分析和KEGG通路分析。结果筛选获得差异表达的lncRNA有236个(上调130个,下调106个);差异表达mRNA有71个(上调66个,下调5个)。差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA取交集筛选获得57个基因。GO和KEGG通路富集分析结果显示:这些差异表达lncRNA主要与精、赖氨酸跨膜转运,氧化应激反应及发育过程相关,并且主要富集在细胞因子受体信号通路、胰高血糖素和胰岛素信号通路及癌症相关信号通路上。结论ghrelin作用后的人卵巢癌细胞中lncRNA的表达有差异,其可能参与卵巢癌的发生、发展,提示ghrelin可能在卵巢癌治疗中具有重要作用。
关 键 词:卵巢癌 二代测序技术 GHRELIN 长链非编码RNA
分 类 号:R737.31]
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