期刊文章详细信息
基于Discovery Studio平台对TGF-β1中药小分子抑制剂的虚拟筛选
Virtual screening of TGF-β1 inhibitors of Chinese materia medica small molecule based on Discovery Studio platform
文献类型:期刊文章
TANG Biao;WANG Hao-xiang;FU Xiao-li;HUANG Lu;CHEN Hui;TANG Zi-zhong;YAO Hui-peng;SHAN Zhi;WANG Gang;XIAO Yi-rong(College of Life Sciences,Sichuan Agricultural University,Ya’an 625014,China;Sichuan Food Fermentation Industry Research and Design Institute,Chengdu 611130,China;Sichuan Agricultural University Hospital,Ya’an 625014,China)
机构地区:[1]四川农业大学生命科学学院,雅安625014 [2]四川省食品发酵工业研究设计院,成都611130 [3]四川农业大学校医院,雅安625014 [4]四川农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学实验室,雅安625014
基 金:四川省应用基础研究计划(No.2019YJ0549);四川省科学技术厅苗木工程计划(No.201958);四川省科学技术计划(No.2019YFG0154)。
年 份:2021
卷 号:36
期 号:11
起止页码:6669-6673
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:利用中药化学专业数据库与TCMSP分析平台,运用计算机辅助药物设计技术对转化生长因子-β1(TGF-β1)蛋白进行虚拟筛选,寻找潜在的中药小分子抑制剂。方法:通过Discovery Studio 2.5(DS)软件进行药效团模型的构建,应用Hypogen算法预测出潜在活性位点,并分别使用Ramanchandran Plot和Profile-3D评估模型,利用优化的模型进行对实验中药小分子库进行虚拟筛选,最后对筛选出的中药进行ADMET性质预测和分子动力学模拟。结果:应用Hypogen算法成功预测出6个潜在活性位点且模型表现良好,成功从黄芪、丹参、三七中筛选出4种与TGF-β1结合良好的天然小分子化合物,并分析了其结合模式。结论:黄芪、丹参、三七的抑癌效果很可能是通过抑制TGF-β1的激活实现的。
关 键 词:转化生长因子-Β1 中药小分子抑制剂 分子对接 虚拟筛选
分 类 号:R285[中药学类]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...