期刊文章详细信息
基于虚拟筛选从中药中发现抗铜绿假单胞菌的活性成分
Discovery of active ingredients against Pseudomonas aeruginosa from traditional Chinese medicine based on Virtual screening
文献类型:期刊文章
XU Ming-xin;CHEN Shuang-kou;GUAN Tian-bing;REN Feng-ming;TENG Jin-feng;TAN Xiao-qing(Chongqing Key Laboratory of Industrial Fermentation Microorganism(Chongqing University of Science and Technology),Chongqing 401331,China;Department of chemistry and chemical engineering,Chongqing University of Science and Technology,Chongqing 401331,China;Institute of Medicinal Plant Cultivation,Chongqing 408435,China)
机构地区:[1]工业发酵微生物重庆市重点实验室(重庆科技学院),重庆401331 [2]重庆科技学院化学化工学院,重庆401331 [3]重庆市药物种植研究所,重庆408435
基 金:工业发酵微生物重庆市重点实验室开放基金项目(GYFJWSW-08)资助。
年 份:2022
卷 号:34
期 号:4
起止页码:754-763
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:针对铜绿假单胞菌的耐药性问题,采用虚拟筛选技术快速筛选出具有抗铜绿假单胞菌活性的中药成分。采用AutoDock Vina程序对铜绿假单胞菌LasR信号受体蛋白的2UV0、3IX3和6MVM三个共晶结构进行方法学研究,然后利用Lipinsky规则对陶术中药数据库进行初步筛选,通过分子对接进行再次筛选,并对满足Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验。研究结果表明3IX3靶点蛋白分子对接模型具有较强的活性分子富集能力,基于该模型对陶术中药数据库进行虚拟筛选后发现符合Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物7个,目筛后得到潜在活性分子5个,体外抑菌实验发现黄芩素-7-甲醚有明显抗菌活性,其最小抑菌浓度为500μg·mL^(-1)。本研究理论结合实验发现黄芩素-7-甲醚有较好的抗铜绿假单胞菌活性,对抗菌新药的研发具有一定的参考价值。
关 键 词:铜绿假单胞菌 分子对接 虚拟筛选 中药成分
分 类 号:R284[中药学类]
参考文献:
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