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期刊文章详细信息

基于免疫相关lncRNAs的胃癌早期诊断和预后风险模型的构建和验证    

Construction and validation of a risk model for early diagnosis and prognosis of gastric cancer based on immune-related lncRNAs

  

文献类型:期刊文章

作  者:王洪英[1] 李岩[1] 韩鑫浩[1] 魏孝礼[2] 贾慧珣[3] 袁文娟[4] 张秋菊[1]

WANG Hongying;LI Yan;HAN Xinhao;WEI Xiaoli;JIA Huixun;YUAN Wenjuan;ZHANG Qiuju(Department of Health Statistics,School of Public Health,Harbin Medical University,Harbin 150086,China;Ward 1,Department of Gastroenterology,Harbin Medical University Cancer Hospital;The First People′s Hospital Affiliated to Shanghai Jiao Tong University;Yuelai Town Health Center,Huachuan County)

机构地区:[1]哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计教研室,哈尔滨150086 [2]哈尔滨医科大学附属肿瘤医院消化内科第一病房 [3]上海交通大学附属第一人民医院 [4]桦川县悦来镇卫生院

出  处:《实用肿瘤学杂志》

基  金:国家自然基金面上项目(编号:82073666);国家自然基金青年基金(编号:82003554);北京医学奖励基金会项目(编号:YXJL-2020-0785-0976)。

年  份:2022

卷  号:36

期  号:2

起止页码:119-126

语  种:中文

收录情况:CAB、CAS、JST、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的基于胃癌免疫相关lncRNAs,建立早期诊断模型和预后风险模型,为胃癌早期诊断和预后预测提供数据支持。方法利用TCGA-STAD数据集与immport数据库筛选胃癌相关免疫lncRNAs。将TCGA-STAD作为训练集,利用logistic回归分析构建胃癌早期诊断模型;单因素Cox和LASSO回归分析用于筛选影响患者总生存期的免疫lncRNAs并构建预后基因标签,最后结合基因标签和患者临床指标,构建胃癌预后风险模型。胃癌基因芯片数据集GSE54129和GSE62254分别作为诊断和预后模型的验证集进行外部验证。结果筛选出9个免疫相关lncRNAs用于构建胃癌早期诊断模型,模型构建和验证的Hosmer-Lemeshow检验P值分别为0.9982和1.0000,ROC曲线下面积分别为0.991和0.958。获得6个影响患者总生存期的免疫lncRNAs用于构建基因标签。根据标签风险得分中位数将患者分为高、低风险组,生存分析表明高风险组患者总生存率低于低风险组患者(训练集及验证集,P<0.05)。生存状态预测基因标签构建构建及验证的C-index分别为0.61和0.59,1、3、5年总生存率ROC曲线下面积分别为0.623、0.623、0.677和0.581、0.613、0.622。多因素Cox回归分析表明基因标签、年龄、肿瘤分期是影响胃癌患者总生存率的独立预后因素,以此构建预后风险模型。C-index、ROC曲线和校准曲线分析表明,预后风险模型的预测效能优于基因标签。结论早期诊断模型可以有效协助胃癌早期筛查;基因标签是影响胃癌患者总生存率的独立因素,可以中等程度地预测患者的预后,相比而言,预后风险模型可以进一步提高模型的预测能力。

关 键 词:胃癌 诊断  预后 免疫相关长链非编码RNAs  

分 类 号:R735.2]

参考文献:

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耦合文献:

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同被引文献:

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