文献类型：期刊文章

作　　者：李新洋[1] 连相尧[1] 白璐[1] 员文静[1] 赵如涵[1] 钮淋[3] 刘镭[4] 王阳[2] 朱翠敏[1]

LI Xin-yang;LIAN Xiang-yao;BAI Lu;YUN Wen-jing;ZHAO Ru-han;NIU Lin;LIU Lei;WANG Yang;ZHU Cui-min(Department of Oncology,Affiliated Hospital of Chengde Medical University,Chengde 067000,Hebei,China;Department of Hematology,Affiliated Hospital of Chengde Medical University,Chengde 067000,Hebei,China;Department of Human Anatomy,School of Basic Medical Science,School of Basic Medical Science,Chengde Medical University,Chengde 067000,Hebei,China;Department of Immunology,School of Basic Medical Science,Chengde Medical University,Chengde 067000,Hebei,China)

机构地区：[1]承德医学院附属医院肿瘤科,承德067000 [2]承德医学院附属医院血液科,承德067000 [3]承德医学院基础医学院人体解剖学教研室,承德067000 [4]承德医学院基础医学院基础医学院免疫学教研室,承德067000

出　　处：《医学研究生学报》

基　　金：国家自然科学基金(81703001);河北省自然科学基金(H2020406050)。

年　　份：2022

卷　　号：35

期　　号：3

起止页码：283-290

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、IC、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的高通量测序技术的发展使得大量miRNA被发现。文中构建非小细胞肺癌(NSCLC)预后相关的内源性竞争性RNA(ceRNA)调控网络,探讨NSCLC中分子调控机制。方法通过miRNA芯片技术筛选NSCLC组织及其配对癌旁组织中差异表达的miRNA(DEmiRNA),应用targetScan、miRtarBase、miRDB、miRCode和lncBase数据库预测DEmiRNA的靶mRNA和与之作用的lncRNA,整合miRNA-mRNA和miRNA-lncRNA作用对,构建NSCLC的ceRNA网络。进一步,将靶mRNA基因导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,同时导入STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并筛选关键模块和基因。应用Kaplan-Meier Plotter在线数据库对关键基因进行生存分析,基于生存分析结果进一步提取与NSCLC患者预后相关的亚ceRNA网络。结果筛选在NSCLC组织及其配对癌旁组织中差异最显著的20个miRNA,根据数据库预测结果成功构建了包含有3个miRNA、130个mRNA和6个lncRNA的ceRNA网络。GO和KEGG分析结果显示共富集出有意义的861个生物过程、66个细胞组分、107个分子功能、32个KEGG条目。通过分析PPI网络结果,得到了3个关键模块和11个关键基因,其中8个关键基因与NSCLC患者预后有关。基于这8个基因,提取了包含有2个miRNA、5个lncRNA和8个mRNA预后相关的亚ceRNA网络。结论成功构建NSCLC预后相关的ceRNA网络,为NSCLC的机制研究提供了新的参考依据。

关 键 词：基因芯片 非小细胞肺癌 预后 内源性竞争性RNA  

分 类 号：R734􀆰]