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期刊文章详细信息

一株水貂博卡病毒全基因组扩增及序列分析    

Genome Amplification and Sequencing of the Mink Bocavirus

  

文献类型:期刊文章

作  者:于永乐[1] 姚延珠[2] 张传美[1] 秦志华[1] 张洪亮[1] 杨瑞梅[1] 段笑笑[3] 单虎[1]

YU Yongle;YAO Yanzhu;ZHANG Chuanmei;QIN Zhihua;ZHANG Hongliang;YANG Ruimei;DUAN Xiaoxiao;SHAN Hu(College of Veterinary Medicine,Qingdao Agricultural University,Qingdao 266109,China;College of Plant Health and Medicine,Qingdao Agricultural University,Qingdao 266109,China;Qingdao Animal Disease Prevention and Control Center,Qingdao 266000,China)

机构地区:[1]青岛农业大学动物医学院山东省预防兽医学重点实验室,青岛266109 [2]青岛农业大学植物医学学院,青岛266109 [3]青岛市动物疫病预防控制中心,青岛266000

出  处:《病毒学报》

基  金:在青高校服务青岛产业发展重点学科(兽医学)(项目号:青教办字2019-69);青岛农业大学高层次人才科研基金(项目号:663/1120015),题目:犬细小病毒VP2蛋白相关功能位点的研究。

年  份:2022

卷  号:38

期  号:2

起止页码:439-447

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:本研究旨在研究水貂博卡病毒(Mink bocavirus,MBoV)在山东省的流行状况及基因特征。采用PCR对采自山东省境内水貂养殖场的85份水貂腹泻样品进行MBoV检测,挑选1份单阳性样品进行全基因扩增,使用MegAlign进行序列同源性比对分析,利用DNAMAN V6对基因组5’末端和3’末端回文结构进行预测,应用MEGA V6进行遗传进化分析。结果表明,所采集的腹泻样品中MBoV阳性率为3.5%(3/85),其中1份为MBoV单阳性,2份为MBoV与水貂肠炎病毒(Mink enteritis virus,MEV)双阳性。获得MBoV全基因序列1条(SDMBoV2020),全长5 252 bp;经分析,5’-和3’-UTR分别由98和145 bp短回文序列组成,具有典型的细小病毒末端的茎环样结构;基因组含有3个ORFs,分别编码非结构蛋白NS1、NP1以及结构蛋白VP1和VP2;SDMBoV2020与NCBI登录的MBoV参考毒株KU950356各编码基因的推导氨基酸序列同源性较高,为98.5%~99.0%;基于MBoV全基因序列构建的系统发育进化树也显示,SDMBoV2020和参考毒株KU950356株同处于MBoV 1型基因群分支上,亲缘关系较近。

关 键 词:水貂博卡病毒  基因组扩增  进化分析

分 类 号:S858.92]

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