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期刊文章详细信息

水稻NCED基因家族生物信息学分析    

Bioinformatics Analysis of NCED Gene Family in Rice

  

文献类型:期刊文章

作  者:周煌[1] 张议斤[1] 罗志雄[1] 唐文帮[1,2] 张桂莲[1,2]

Zhou Huang;Zhang Yijing;Luo Zhixiong;Tang Wenbang;Zhang Guilian(College of Agronomy,Hunan Agricultural University,Changsha,410128;Key Laboratory of Rice and Rapeseed Disease Resistance Breeding of Hunan Province,College of Agronomy,Hunan Agricultural University,Changsha,410128)

机构地区:[1]湖南农业大学农学院,长沙410128 [2]湖南农业大学农学院水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,长沙410128

出  处:《分子植物育种》

基  金:国家自然科学基金项目(31871599);湖南省重点研发计划项目(2017NK2071);作物学开放基金项目(ZWKF201504);湖南农业大学“双一流”建设项目(SYL2019007)共同资助。

年  份:2022

卷  号:20

期  号:4

起止页码:1060-1067

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(简称NCED)作为高等植物ABA合成步骤的关键限速酶,其特征解析有助于对植物ABA合成的认识。通过生物信息学方法,从基本理化性质、二级结构、染色体定位、基因结构、蛋白质保守结构域、进化树、启动子顺式作用元件及表达模式等方面,对水稻NCED基因家族的结构和特征进行分析。结果表明,水稻NCED基因家族有5个成员,分布于第2、3、7、12号染色体上,均没有内含子,只由一个外显子组成;编码蛋白属于亲水性蛋白,无信号肽,含有典型的RPE65保守结构域,主要分布于叶绿体中,二级结构主要由无规则卷曲和延伸链组成,没有β-折叠结构;进化分析表明水稻与玉米的亲缘关系较近;顺式作用元件分析表明其可能受光、温度、氧气以及生长素、赤霉素、水杨酸、脱落酸等激素调控;NCED基因家族在水稻根和芽响应不同植物激素的表达量存在差异。本研究为水稻NCED基因家族成员的生物学功能研究提供理论依据。

关 键 词:水稻 NCED基因家族  生物信息学分析

分 类 号:S511]

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