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期刊文章详细信息

结核分枝杆菌hemZ蛋白的生物信息学分析    

Bioinformatics analysis of the hemZ protein of Mycobacterium tuberculosis

  

文献类型:期刊文章

作  者:李敏英[1] 王楚彤[1] 袁美丽[1] 李柏青[1,2] 许涛[3] 汪洪涛[1,2]

LI Min-ying;WANG Chu-tong;YUAN Mei-li;LI Bai-qing;XU Tao;WANG Hong-tao(Anhui Province Key Laboratory of Im mumology in Chronic Diseases,Bengbu Medical College,Bengbru,Anhui 233030,China;Department of Immunology,School of laboratory Medicine,Bengbu Medical College;Department of Clin-ical Laboratory,School of laboratory Medicine,Bengbu Medical College)

机构地区:[1]蚌埠医学院慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室,安徽蚌埠233030 [2]蚌埠医学院检验医学院免疫学教研室 [3]蚌埠医学院检验医学院临床检验诊断学教研室

出  处:《中国病原生物学杂志》

基  金:安徽省自然科学基金项目(No.1908085MH252,2008085QH405)。

年  份:2021

卷  号:16

期  号:12

起止页码:1382-1386

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的应用生物信息学软件预测结核分枝杆菌hemZ蛋白的结构和功能。方法从NCBI中获得hemZ蛋白编码的基因序列,运用生物信息学软件ORF Finder、MEGA、BLAST、Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP4.1 Server、NetPhos3.1 Server、NetAcet1.0 Server、NetNGlyc1.0 Server、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、STRING、MEGA等工具对Rv1485基因编码蛋白hemZ的结构和功能等相关的生物学信息进行预测。结果hemZ蛋白由Rv1485基因编码,该基因全长1035 bp,有8个开放阅读框,由344个氨基酸组成,等电点为5.69,跨膜氨基酸数为0.07436,无信号肽、乙酰化位点和N-糖基化位点,有23个磷酸化位点;蛋白二级结构中α-螺旋占43.31%,β-折叠占11.63%,β-转角占2.33%,无规则卷曲占42.73%;有10个B细胞抗原表位和14个T细胞抗原表位;hemZ蛋白存在于致病性分枝杆菌中,且在其他分枝杆菌中存在相似序列。结论预测结核分枝杆菌hemZ蛋白具有磷酸化位点及良好的T、B细胞表位,且有多个互作蛋白,可作为结核病多肽疫苗的重要候选蛋白。

关 键 词:hemZ蛋白  结核分枝杆菌 Rv1485  生物信息学分析

分 类 号:R378.911]

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