文献类型：期刊文章

作　　者：张钰坤[1,2] 陆赢[1,2] 崔看[3] 夏石头[3] 刘忠松[1,2]

ZHANG Yu-Kun;LU Ying;CUI Kan;XIA Shi-Tou;LIU Zhong-Song(Crop Gene Engineering Key Laboratory of Hunan Province/College of Agronomy,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,Hunan,China;Hunan Branch of National Oilseed Crops Improvement Center,Changsha 410128,Hunan,China;College of Bioscience and Biotechnology of Hunan Agricultural University,Changsha 410128,Hunan,China)

机构地区：[1]湖南农业大学农学院/作物基因工程湖南省重点实验室,湖南长沙410128 [2]国家油料作物改良中心湖南分中心,湖南长沙410128 [3]湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128

出　　处：《作物学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(U20A2029)资助。

年　　份：2022

卷　　号：48

期　　号：6

起止页码：1325-1332

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、DOAJ、EAPJ、EBSCO、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：在芸薹属植物中TT8基因是种子颜色的调控基因。异源四倍体芥菜TT8基因有2个拷贝,分别位于A09与B08染色体上。本研究针对不同拷贝设计特异引物,对749份芥菜进行扩增、测序或酶切检测,发现BjuA09.TT8和BjuB08.TT8各有7个和6个等位变异。与野生型相比, BjuA09.TT8.a1-a5和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因都发生了大片段插入,而BjuA09.TT8.a6出现了删除,但BjuB08.TT8.b5仅在第7外显子处有1个碱基替换。使用Repeatmasker软件对等位基因序列与甘蓝型油菜注释库进行重复序列比对,发现BjuA09.TT8.a1-a4和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因主要含有Ⅰ类转座子,少量为Ⅱ类转座子及Helitron类转座子插入。统计还发现, BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b5单倍型为主要的黄籽单倍型,占所分析黄籽材料的89.49%(247/276),其次为BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b3单倍型,占6.52%。地理分布分析结果显示,中国尤其是新疆芥菜黄籽突变等位基因频率显著高于世界其他地区,这与历史记载相印证,说明芥菜黄籽性状可能起源于中国新疆。本研究结果为油菜黄籽育种选用优异基因资源提供了依据。

关 键 词：芥菜 黄籽 TT8  等位变异 转座子 种质资源  地理分布  

分 类 号：S565.4]