文献类型：期刊文章

作　　者：尚永朋[1,2] 赵宇曦[2] 邓名贵[2] 欧阳莉丽[1,2] 彭壬海[2] 李佩玉[2] 余治健[2] 邓启文[1,2]

SHANG Yong-peng;ZHAO Yu-xi;DENG Ming-gui;OUYANG Li-li;PENG Ren-hai;LI Pei-yu;YU Zhi-jian;DENG Qi-wen(Guangdong Key Laboratory for Biomedical Measurements and Ultrasound Imaging,Shenzhen University Health Science Center,School of Biomedical Engineering,Shenzhen 518052,China;Department of Infectious Diseases,Huazhong University of Science and Technology Union Shenzhen Hospital,The 6th Affiliated Hospital of Shenzhen University Health Science Center,Shenzhen 518052,China)

机构地区：[1]深圳大学医学部生物医学工程学院,广东省生物医学信息检测与超声成像重点实验室,广东深圳518052 [2]华中科技大学协和深圳医院深圳大学医学部第六附属医院感染科,广东深圳518052

出　　处：《中国感染控制杂志》

基　　金：深圳市南山区卫生科技计划项目(NS2021009、NS2021140)。

年　　份：2022

卷　　号：21

期　　号：4

起止页码：317-322

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在医院聚集性感染事件中快速识别感染源的可行性和实用性。方法收集某院新生儿中心6例发热伴腹泻或皮疹新生儿的咽、肛拭子和血标本,同时期同病室其他新生儿和医护人员(咽、肛拭子)标本,以及环境标本,采用传统培养方法、肠道病毒通用聚合酶链反应(PCR)、mNGS和肠道埃可病毒18(ECO18)型特异性PCR进行检测。结果6例新生儿血及肛、咽拭子标本细菌培养未检出病原体,肛拭子肠道病毒通用PCR和ECO18型特异性PCR检测均阳性。mNGS从6例新生儿不同标本中至少一份检出ECO18型病原体,阳性率由高至低依次为肛拭子(66.66%)、血(50.00%)和口咽拭子(0)。采用mNGS检测同时期同病房18例无症状新生儿咽和肛拭子标本,2例新生儿肛拭子标本ECO18型检测阳性。医务人员以及环境标本未检出ECO18型或其他肠道病毒。结论mNGS可检测出ECO18型感染患者粪便或血清中低拷贝数的ECO18型病毒,是一种有效的辅助性诊断肠道病毒感染的方法,并且具有追溯医院聚集性肠道病毒感染病原体的潜力。

关 键 词：新生儿 宏基因组测序  快速诊断  埃可病毒18型  聚集性感染  

分 类 号：R512.9]