文献类型：期刊文章

作　　者：贾慧琼[1,2] 阮陟[3,4]

JIA Huiqiong;RUAN Zhi(Department of Laboratory Medicine,the First Affiliated Hospital,Zhejiang University,Hangzhou 310003,Zhejiang,China;Key Laboratory of Clinical In vitro Diagnostic Techniques of Zhejiang Province,Hangzhou 310003,Zhejiang,China;Department of Biomedical Research Center,Sir Run Run Shaw Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310016,Zhejiang,China;Key Laboratory of Microbial Technology and Bioinformatics of Zhejiang Province,Hangzhou 310016,Zhejiang,China)

机构地区：[1]浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江杭州310003 [2]浙江省临床体外诊断技术研究重点实验室,浙江杭州310003 [3]浙江大学医学院附属邵逸夫医院生物医学研究中心,浙江杭州310016 [4]浙江省微生物技术与生物信息研究重点实验室,浙江杭州310016

出　　处：《微生物学报》

基　　金：国家自然科学基金(82102436,81401698);浙江省自然科学基金(LY21H190001);浙江省公益技术研究计划(LGF18H190001)。

年　　份：2022

卷　　号：62

期　　号：3

起止页码：949-967

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：细菌分子分型已成为监测细菌感染性疾病的暴发流行与明确病原菌传播途径的重要工具。随着全基因组测序技术的日益兴起,公共数据库中已产生大量的细菌基因组数据,迫切需要研究人员充分认识和理解该技术,并掌握多种生物信息学工具挖掘并解读测序数据。本文系统概述了全基因组测序技术与生物信息学工具在病原菌分型与溯源中的应用,并对全基因组测序技术在临床诊疗实践中存在的挑战以及未来应用前景进行了探讨。

关 键 词：全基因组测序 生物信息学 基因组流行病学  分型与溯源  暴发流行  

分 类 号：R446.5]