文献类型：期刊文章

作　　者：黄和荣[1] 董莹[2] 邓艳[2] 徐艳春[2] 陈梦妮[2] 刘言[2] 张苍林[2]

HUANG He-rong;DONG Ying;DENG Yan;XU Yan-chun;CHEN Meng-ni;LIU Yan;ZHANG Cang-lin(Department of Basic Medical Sciences,Clinical College of Anhui Medical University,Hefei,Anhui 230031,China;Yunnan In-stitute of Parasitic Diseases Control,Yunnan Centre of Malaria Research,Yunnan Provincial Key Laboratory of Vector-borne Dis-eases Control and Research,Pu’er,Yunnan 665000,China)

机构地区：[1]安徽医科大学临床医学院基础医学部,安徽合肥230031 [2]云南省寄生虫病防治所、云南省疟疾研究中心、云南省虫媒传染病防控研究重点实验室,云南普洱665000

出　　处：《中国血吸虫病防治杂志》

基　　金：国家自然科学基金(81660559,81960579)。

年　　份：2022

卷　　号：34

期　　号：1

起止页码：28-35

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的分析4种人体疟原虫乳酸脱氢酶(Plasmodium lactate dehydrogenase,pLDH)基因多态性并预测pLDH肽链B细胞抗原表位。方法收集传染病报告信息管理系统中登记的云南省疟疾病例血样和流行病学等信息。采用巢式PCR技术扩增4种人体疟原虫pLDH基因并测序,应用MEGA 7.0.26和DnaSP 5.10软件分析4种人体疟原虫p LDH基因DNA序列多态性,并采用免疫表位数据库(IEDB)预测pLDH肽链B细胞抗原表位。结果分别从153份间日疟、29份恶性疟、17份卵形疟和11份三日疟患者血样中获得间日疟原虫LDH(PvLDH)、恶性疟原虫LDH(PfLDH)、卵形疟原虫LDH(PoLDH)、三日疟原虫LDH(PmLDH)基因测序序列,分别定义15、2、4、2种单倍型,核苷酸多样性指数(π)为0.104。Po LDH基因种内分化程度较高,π为0.012;PvLDH、PfLDH和PmLDH基因π值均<0.001。4种人体疟原虫pLDH肽链可预测到4~5个/链的B细胞抗原活性区,活性得分约0.430;其中活性区短肽"86-PGKSDKEWNRD-96"为4种人体疟原虫共有的B细胞抗原表位,"266-GQYGHS(T)-271"仅出现在PvLDH和PoLDH肽链,PvLDH、PfLDH肽链特有的B细胞抗原表位分别是"212-EEVEGIFDR-220"和"208-LISDAE-213"。结论PoLDH基因多态性可能来自微弱的负向纯化选择,PvLDH、PfLDH、PmLDH基因则可能维持了相对保守状态。p LDH肽链近C端可能存在可区分间日疟、恶性疟原虫感染的B细胞抗原表位"212-EEVEGIFDR-220"和"208-LISDAE-213"。

关 键 词：人体疟原虫  乳酸脱氢酶 基因多态性 B细胞表位 表位预测

分 类 号：R384.1]