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黄精转录组特性分析及相关功能基因研究
Characteristic Analysis of Polygonatum Sibiricum Transcriptome and Study of Related Functional Genes
文献类型:期刊文章
WANG Yu;TAN Fuyan;ZHANG liping;HE yufeng;FAN Jianhui;LI Wang;PENG Shijie;QIU Qinghua(Attached Hospital,Panzhihua University,Panzhihua 617000,Sichuan;Medical College,Panzhihua University,Panzhihua 617000,Sichuan;School of Health and Wellness,Panzhihua University,Panzhihua 617000,Sichuan)
机构地区:[1]攀枝花学院附属医院,四川攀枝花617000 [2]攀枝花学院医学院,四川攀枝花617000 [3]攀枝花学院康养学院,四川攀枝花617000
基 金:四川省高校重点实验室开放课题(SCYZ201901)。
年 份:2022
卷 号:45
期 号:1
起止页码:103-109
语 种:中文
收录情况:AJ、CAS、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZMATH、普通刊
摘 要:分析黄精转录组数据,挖掘与黄精中多糖、皂苷元、黄酮生物合成途径相关的关键酶基因.利用Illumina HiSeq测序平台对黄精全株进行转录组测序,对测序结果进行注释分析.共获得146 072个有效转录本,超过51.00%的转录本在NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中获得注释.β-呋喃果糖苷酶、己糖激酶等参与了黄精多糖的生物合成;UDP-葡萄糖基转移酶、β-葡萄糖苷酶等参与黄精皂苷元的生物合成途径;查尔酮异构酶、查尔酮合成酶等参与黄精内黄酮的生物合成途径.初步获得黄精中参与黄精多糖、皂苷元、黄酮生物合成的候选关键酶基因,为进一步研究黄精的生理生化代谢奠定了基础.
关 键 词:黄精 转录组 多糖 皂苷 黄酮
分 类 号:R282.12[中药学类]
参考文献:
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引证文献:
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