期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]上海交通大学生命科学学院生物信息与生物统计系,200240 [2]上海交通大学转化医学研究院
年 份:2022
卷 号:39
期 号:1
起止页码:149-152
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用。方法基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上。以UK Biobank乳腺癌数据为例,对其临床及基因数据进行分析,查看R-shiny应用的分析效果。结果构建出能够交互式分析临床数据的R-shiny应用,可供用户上传临床数据、生存型数据及基因数据进行分析。将UK Biobank数据作为示例进行分析,得到了具有临床与生物学意义的结果。结论将R-shiny与临床数据分析结合,为使用者提供了分析临床数据的简便方式,并为UK Biobank数据提供新的交互式展示分析平台。
关 键 词:R-shiny 临床数据 生存分析 变量选择 GWAS
分 类 号:R331]
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