期刊文章详细信息
文献类型:期刊文章
Wenyi Peng;Zhiying Wu;Xiaoxuan Luo;Sijie Chen;Shiyan Zhou;Suping Deng;Xiang Luo;Shaolong Feng;Qinqin Bai(School of Public Health,University of South China,Hengyang 421001,Hunan Province,China;Key Laboratory of Hengyang for Health Hazard Factors Inspection and Quarantine,Hengyang 421001,Hunan Province,China;Hengyang Medical College,University of South China,Hengyang 421001,Hunan Province,China;The Institute of Preventive Medicine,School of Public Health,Guilin Medical University,Guilin 541004,Guangxi Zhuang Autonomous Region,China;Guangdong Provincial Key Laboratory of Environmental Protection and Resources Utilization,The State Key Laboratory of Organic Geochemistry,Guangzhou Institute of Geochemistry,Chinese Academy of Sciences,Guangzhou 510640,Guangdong Province,China)
机构地区:[1]南华大学公共卫生学院,湖南衡阳421001 [2]衡阳市健康危害因子检验检疫新技术研究重点实验室,湖南衡阳421001 [3]南华大学衡阳医学院,湖南衡阳421001 [4]桂林医学院公共卫生学院,预防医学研究所,广西桂林541004 [5]中国科学院广州地球化学研究所,有机地球化学国家重点实验室,广东省环境资源利用与保护重点实验室,广东广州510640
基 金:湖南省自然科学基金(2019JJ50494);湖南省教育厅科学研究项目(16C1390);湖南省重点实验室资助项目(2019TP1027);南华大学大学生创新项目(X202010555385)。
年 份:2021
卷 号:61
期 号:12
起止页码:3952-3964
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】预测并分析82株全基因组测序的鲍曼不动杆菌前噬菌体的携带情况,鉴定前噬菌体编码的抗生素耐药基因和毒力因子。【方法】利用PHASTER(Phage Search Tool Enhanced Release)软件预测鲍曼不动杆菌携带的前噬菌体,采用CARD(The Comprehensive Antibiotic Research Database)和VFDB(Virulence Factors Database)在线分析软件预测前噬菌体编码的抗生素耐药基因和毒力因子。【结果】预测到472条鲍曼不动杆菌前噬菌体,其中完整型前噬菌体201条,疑似型前噬菌体91条,缺陷型前噬菌体180条。平均每株鲍曼不动杆菌基因组中可携带至少2条完整型前噬菌体。每株鲍曼不动杆菌所携带的全部前噬菌体占其基因组比例约为4%–6%。29条前噬菌体携带77个耐药基因,耐药表型共有14种,分别来自15个不同的家族,涵盖6种抗生素耐药的作用机制。132条前噬菌体编码毒力基因,归类为38种毒力基因和34种毒力因子。不同类型的前噬菌体普遍携带1–2种毒力因子,少数前噬菌体携带3种及以上毒力因子。分析毒力因子可能的宿主来源构成比发现,除鲍曼不动杆菌外,脑膜炎奈瑟菌、痢疾志贺氏菌、嗜肺军团菌及其亚种等也有较高的结构比例,是可能的宿主来源。【结论】鲍曼不动杆菌普遍携带前噬菌体,但前噬菌体基因在鲍曼不动杆菌基因组中所占比例不高。部分前噬菌体携带抗生素耐药基因,以氨基糖苷类、磺胺类及β-内酰胺类耐药为主。约30%的前噬菌体携带毒力基因。前噬菌体可能在鲍曼不动杆菌抗生素耐药性的获得、传播及致病性演变中发挥重要作用。
关 键 词:鲍曼不动杆菌 前噬菌体 基因组学 耐药基因 毒力因子
分 类 号:R378]
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