文献类型：期刊文章

作　　者：曹洁[1] 李文晋[1] 王一飞[1] 安国帅[1] 卢晓军[1,2] 杜秋香[1] 李晋[3] 孙俊红[1]

CAO Jie;LI Wen-jin;WANG Yi-fei;AN Guo-shuai;LU Xiao-jun;DU Qiu-xiang;LI Jin;SUN Jun hong(School of Forensic Medicine,Shanxi Medical University,Taiyuan 030001,China;Criminal Investigation Detachment,Baotou Public Security Bureau,Baotou 014030,Inner Mongolia Autonomous Region,China;Second Hospital of Shanxi Medical University,Taiyuan 030001,China)

机构地区：[1]山西医科大学法医学院,山西太原030001 [2]包头市公安局刑事侦查支队,内蒙古包头014030 [3]山西医科大学第二医院,山西太原030001

出　　处：《法医学杂志》

基　　金：国家自然科学基金面上资助项目(81971795);山西省应用基础研究青年科技资助项目(201801D221264)。

年　　份：2021

卷　　号：37

期　　号：5

起止页码：621-626

语　　种：中文

收录情况：CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的采用16S rRNA高通量测序技术探究大鼠肠道菌群变化与死亡时间(postmortem interval,PMI)之间的关系。方法大鼠腹腔麻醉致死后置于16℃,提取死后0、1、2、3、5、7、9、12、15、18、21、24、27和30 d共14个时间点的盲肠内容物DNA,采用16S rRNA高通量测序技术,检测大鼠盲肠内容物中的肠道菌群,对数据进行多样性及差异性分析。结果死后30 d内大鼠肠道微生物菌群总数未发生明显变化,但菌群多样性呈上升趋势。在死后13个时间点共筛选出119个具有显著差异的细菌群落。构建全部时间点、9 d前、12 d后PMI推断的偏最小二乘(partial least squares,PLS)回归模型,其决定系数(R2)分别为0.795、0.767和0.445;交叉验证均方根误差分别为6.57、1.96和5.37 d。结论利用16S rRNA高通量测序技术探究死后30 d内肠道菌群的变化规律,其组成和结构出现了明显的变化,且建立的PLS回归模型表明PMI与肠道菌群之间高度相关,呈一定时序性变化。

关 键 词：法医病理学 16S rRNA  死亡时间推断 肠道菌群 高通量测序 大鼠  

分 类 号：D919.1[法医学类]