期刊文章详细信息
基于HMMR在肺腺癌组织中表达水平及其对LUAD患者预后影响的生物信息学分析
Bioinformatics analysis based on expression level of HMMR in lung adenocarcinoma tissue and its impact on prognosis of LUAD patients
文献类型:期刊文章
LI Shuzhen;CAO Yajie;GENG Haiying;CAI Zengxiaorui;DAI Chunmei;WEN Youfeng;LI Ning(Department of Biochemistry and Molecular Biology,College of Basic Medical Sciences,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China;College of Pharmacy,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China;Department of Human Anatomy,College of Basic Medical Sciences,Jinzhou Medical University,Jinzhou 121000,China;Liaoning Key Research Laboratory of Human Phenoomic,Jinzhou 121000,China)
机构地区:[1]锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,辽宁锦州121000 [2]锦州医科大学药学院,辽宁锦州121000 [3]锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室,辽宁锦州121000 [4]辽宁省人类表型组学重点研究实验室,辽宁锦州121000
基 金:国家自然科学基金项目(31400646);辽宁省教育厅高等学校创新人才项目(LR2019028)。
年 份:2021
卷 号:47
期 号:6
起止页码:1502-1509
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:探讨透明质酸介导的细胞游走受体(HMMR)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达及其对LUAD患者预后的影响,阐明HMMR在LUAD发生发展中的作用。方法:通过基因表达汇编(GEO)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和人类蛋白图谱(HPA)数据库评估LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平。采用GEPIA2数据库分析HMMR表达对LUAD患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)的影响,采用TCGA数据库分析HMMR mRNA表达与LUAD患者临床病理参数及预后的关系,采用GSEA富集分析探讨HMMR在LUAD组织中显著富集的通路,采用UALCAN数据库探讨HMMR mRNA表达与TP53基因突变的关系,采用STRING数据库预测HMMR与p53信号通路中蛋白的相互作用。结果:LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平明显高于正常组织和癌旁组织(P<0.01)。HMMR mRNA表达水平较高的患者OS和DFS更短(P<0.01)。LUAD组织中,HMMR mRNA表达与患者TNM分期、T分期和N分期有关联(P<0.01)。单因素和多因素Cox分析,HMMR mRNA高表达的患者OS更短。GSEA富集分析,细胞周期、同源重组、p53信号通路、膀胱癌、胰腺癌、小细胞肺癌和泛素化介导的蛋白水解等通路显著富集在HMMR高表达显型。结论:LUAD组织中HMMR表达明显上调,高表达的HMMR mRNA是LUAD患者预后差的独立评价指标。
关 键 词:肺腺癌 透明质酸介导的运动受体 数据库 预后
分 类 号:R734.2] Q811.4[临床医学类]
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