文献类型：期刊文章

作　　者：李菲[1] 王宇航[1] 徐陈晨[1] 张永静[1] 李伟玉[1] 陆进[2,3]

Li Fei;Wang Yuhang;Xu Chenchen;Zhang Yongjing;Li Weiyu;Lu Jin(School of Clinical Medicine,Bengbu Medical College,Bengbu 233030,Anhui,China;Department of Human Anatomy,Bengbu Medical College,Bengbu 233030,Anhui,China;Anhui Key Laboratory of Computational Medicine and Intelligent Health,Bengbu Medical College,Bengbu 233030,Anhui,China)

机构地区：[1]蚌埠医学院临床医学院,安徽蚌埠233030 [2]蚌埠医学院人体解剖学教研室,安徽蚌埠233030 [3]蚌埠医学院数字医学与智慧健康安徽省重点实验室,安徽蚌埠233030

出　　处：《右江民族医学院学报》

基　　金：安徽省大学生创新训练项目(S202010367071);教育部产学合作协同育人项目(202101160001)。

年　　份：2021

卷　　号：43

期　　号：5

起止页码：611-616

语　　种：中文

收录情况：JST、普通刊

摘　　要：目的利用生物信息学方法,筛选前列腺癌预后的关键基因。方法首先,从GEO数据库下载4个前列腺癌表达谱芯片数据集(GSE3325/GSE46602/GSE55945/GSE69223);其次,分别利用GEO2R、DAVID以及STRING数据库分析前列腺癌的差异表达基因(DEGs),并对差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集以及蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI);再次,通过Cytoscape软件的Cytohubba插件EPC算法筛选关键基因;最后,利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库对关键基因进行预后与表达分析,利用人类蛋白图谱(HPA)数据库下载TCGA数据对结果进行验证。结果筛选出103个DEGs,其功能主要富集在血管生成、脂质代谢以及细胞分化等方面,而通路主要富集在Hippo信号上。筛选的10个关键基因中仅EDNRB对前列腺癌患者的预后有显著影响,且其低表达不利于患者预后。结论通过生物学分析筛选前列腺癌关键基因,为其治疗提供新的分子靶点。

关 键 词：前列腺肿瘤 计算生物学 基因  总体生存  预后

分 类 号：R737.25]