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期刊文章详细信息

苦荞FtERD家族糖转运基因的鉴定与分析    

Identification and bioinformatics analysis of sugar transporter gene of FtERD family in Tartary buckwheat

  

文献类型:期刊文章

作  者:梁成刚[1] 韦春玉[1] 汪燕[1] 关志秀[1] 邓娇[1] 黄娟[1] 石桃雄[1]

LIANG Chenggang;WEI Chunyu;WANG Yan;GUAN Zhixiu;DENG Jiao;HUANG Juan;SHI Taoxiong(Buckwheat Technology Research Center,School of Life Sciences,Guizhou Normal University,Guiyang,Guizhou 550001,China)

机构地区:[1]贵州师范大学生命科学学院荞麦产业技术研究中心,贵州贵阳550001

出  处:《福建农林大学学报(自然科学版)》

基  金:国家自然科学基金项目(32060511、31660366);贵州省科技支撑项目(黔科合ZC[2019]2298);贵州师范大学博士启动基金项目;贵州省荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金(黔教合KY[2017]002)。

年  份:2021

卷  号:50

期  号:6

起止页码:734-740

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、ZGKJHX、核心刊

摘  要:利用生物信息学方法筛选鉴定出28个FtERDs糖转运基因,其中19个编码蛋白序列且具有跨膜结构域.聚类分析将FtERDs归为4类,类Ⅰ包括13个,类Ⅱ包括9个,类Ⅲ包括1个,类Ⅳ包括5个.转录组测序检测到22个FtERDs在茎中表达,17个为差异表达基因(DEGs),其中仅3个DEGs在苗期10和15 d同时高表达,其余有3个DEGs在5 d高表达,2个DEGs在10 d高表达,9个DEGs在15 d高表达.这些基因可能在不同发育阶段的茎中发挥功能.同时,FtERDs间存在多个显著正相关或负相关,推测FtERDs基因的功能可能存在协同或互补效应.PEG模拟干旱胁迫8 h时,5个FtERDs过量表达,其中FtPinG34458.01、FtPinG85532.01表达量高于对照10倍以上.

关 键 词:苦荞 早期脱水响应基因  糖转运载体  生物信息学 基因表达

分 类 号:Q74]

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