文献类型：期刊文章

作　　者：方萌[1] 池晴佳[2] 赵晗[1] 郭敬[1] 刘宇炜[1]

FANG Meng;CHI Qingjia;ZHAO Han;GUO Jing;LIU Yuwei(Department of Basic Medicine,School of Medicine,Jianghan University,Wuhan 430056;Department of Mechanics and Engineering Structure,Wuhan University of Technology,Wuhan 430070,China)

机构地区：[1]江汉大学医学院基础医学部,湖北武汉430056 [2]武汉理工大学理学院力学系,湖北武汉430070

出　　处：《南京医科大学学报（自然科学版）》

基　　金：湖北省卫生健康科研基金(WJ2021M217);江汉大学高层次人才科研启动基金(20200010)。

年　　份：2021

卷　　号：41

期　　号：8

起止页码：1141-1150

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、IC、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的:通过加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)与最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)考察转录因子SOX12在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生发展中免疫浸润相关的预后价值。方法:利用基因表达(Gene Expression Omnibus,GEO)和肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,采用Kaplan-Meier(K-M)生存曲线和单因素、多因素Cox回归分析SOX12基因表达在HCC中的临床价值。利用ESTIMATE和CIBERSORT算法研究SOX12基因表达与肿瘤免疫微环境的相关性。运用WGCNA和LASSO算法建立风险预后模型,进一步评估高低风险组中SOX12基因表达对HCC患病基因突变的影响。结果:在HCC肿瘤组织中,SOX12的表达显著升高,和年龄、性别、肿瘤等级、疾病分期有关,且与患者生存预后显著相关。在风险预后模型中,高风险组比低风险组的总生存率差。风险预后模型具有显著的预后预测效果,其1年、3年和5年的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为0.823、0.811和0.824。高SOX12表达组中TP53基因突变比例(40%)明显高于低SOX12表达组(25%),表明高低风险组中高低SOX12表达影响HCC患病基因突变的频率。结论:SOX12表达与HCC的免疫浸润和患病基因突变相关,提示其可能成为HCC患者预后评估的潜在靶标。

关 键 词：SOX12  预后价值 肝细胞癌 免疫微环境 基因突变

分 类 号：R735.7]