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芸薹属(Brassica napus,B.rapa,B.oleracea)CAMTA3基因家族的鉴定及生物信息学分析
Identification and Bioinformatics Analysis of CAMTA3 Gene Family from Brassica(Brassica napus,B.rapa,B.oleracea)
文献类型:期刊文章
Luo Qingxuan;Xiang Aoling;Zhang Tao;Lu Junxing(Chongqing Engineering Research Center of Specialty Crop Resources,College of Life Sciences,Chongqing Normal University,Chongqing,401331;Key Laboratory for Innovative Development and Utilization of Oil Peony Germplasm,Chongqing Normal University,Chongqing,401331)
机构地区:[1]重庆师范大学生命科学学院,重庆市特色作物资源工程技术研究中心,重庆401331 [2]重庆师范大学,油用牡丹种质资源创新与利用重点实验室,重庆401331
基 金:重庆市科学技术局基金项目(cstc2017jcyjAX0108,cstc2019jscx-msxm0612);重庆高校创新团队(CXTDX2016-01018);重庆师范大学基金项目(16XYY27,16XYY28)共同资助。
年 份:2021
卷 号:40
期 号:3
起止页码:1238-1247
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:芸薹属(Brassica)植物(甘蓝型油菜,白菜,甘蓝)是重要的经济作物,它们之间的关系可用禹氏三角表示。CAMTA是在进化过程中高度保守的一类转录因子家族,该家族成员在芸薹属植物抗逆境胁迫过程中具有重要作用。为了探讨芸薹属CAMTA3基因家族的功能,本研究利用生物信息学手段,鉴定了芸薹属(白菜,甘蓝和甘蓝型油菜)CAMTA3基因家族的8个基因,并从蛋白质的理化性质、家族进化与基因结构和上游启动子等方面进行了分析研究。分析表明,芸薹属CAMTA3基因家族8个成员在进化过程中具有较高的保守性,其亲缘关系与禹氏三角理论相符,且各成员在植物响应抗胁迫过程中占重要地位。研究结果为芸薹属CAMTA3基因家族的功能研究提供了一定的信息基础。
关 键 词:芸薹属 CAMTA3基因家族 进化 生物信息学
分 类 号:Q943.2[植物生产类]
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