文献类型：期刊文章

作　　者：冯昌增[1] 张名[1] 许丹菡[1] 丛山日[1] 张光贤[1] 徐炽[1] 卢志敏[1] 杨昭庆[1] 马绍辉[1]

Feng Changzeng;Zhang Ming;Xu Danhan;Cong Shanri;Zhang Guangxian;Xu Chi;Lu Zhimin;Yang Zhaoqing;Ma Shaohui(Key Laboratory for Research and Development of Major Infectious Diseases Vaccine in Yunnan,Institute of Medical Biology,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College,Kunming 650118,China)

机构地区：[1]北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室,昆明650118

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》

基　　金：云南省科技计划(202002AA100009,2017FA006)。

年　　份：2021

卷　　号：35

期　　号：4

起止页码：395-403

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、PUBMED、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的:对从云南重症手足口病患者的粪便样品中分离出的1株柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)毒株的全基因组特征和部分区段重组情况进行分析,为深入认识CV-A4的流行和分子进化提供基础数据。方法:分别使用人类横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞、人胚肺二倍体(human embryonic lung diploid,KMB17)细胞和人非小细胞肺癌(human lung cancer,A549)细胞进行病毒分离。提取病毒RNA,通过逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)分段扩增CV-A4全长基因,利用MEGA7.0和SimPlot 3.5.1等软件对全基因组及各区段进行分析。结果:从RD细胞上分离到一株CV-A4分离株R11-20/YN/CHN/2011,系统进化分析显示该分离株属于C2基因亚型。在VP1和全基因组核苷酸序列上与其同源性最高的分别是CV-A4毒株09214/SD/CHN/2009和CVA4/SZ/CHN/09。重组分析显示该分离株与肠道病毒A71(enterovirus A71,EV-A71)云南分离株R993/YN/CHN/2010在3D区发生过重组。结论:CV-A4分离株R11-20/YN/CHN/2011为C2基因亚型且与EV-A71在3D区发生重组。

关 键 词：柯萨奇病毒A组4型  系统进化分析 重组分析  

分 类 号：R73]