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甜菜铵转运蛋白BvAMT1-3基因的克隆及生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of Beta vulgaris Ammonium Transporter 1-3(BvAMT1-3)Gene
文献类型:期刊文章
WEI Duo;LIU Mingxi;GAO Zhuo;LI Jiajia;LIU Dali;MA Longbiao(Key Laboratory of Sugar Beet Genetics and Breeding,Heilongjiang Province Common College/College of Advanced Agriculture and Ecological Environment,Heilongjiang University,Harbin 150080;Key Laboratory of Northern Sugar Crop Resources and Utilization of Chinese Academy of Agricultural Sciences/Sugar Beet Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150080;College of Life Science and Technology,Harbin Normal University,Harbin 150025;College of Life Sciences,Heilongjiang University,Harbin 150080)
机构地区:[1]黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080 [2]中国农业科学院北方糖料作物资源与利用重点实验室/中国农业科学院甜菜研究所,哈尔滨150080 [3]哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,哈尔滨150025 [4]黑龙江大学生命科学学院,哈尔滨150080
基 金:财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(糖料)项目“甜菜养分管理与土壤肥料”(CARS-170204);黑龙江省高校基本科研业务费黑龙江大学专项资金项目“能源甜菜BvMPT11基因的Cd污染生物修复应答机制研究”(KJCX201920);黑龙江省自然基金“BvHIPP24基因在能源甜菜重金属镉污染生物修复中的分子机制研究”(LH2019C057);国家作物种质资源库“甜菜分库运行服务”(NCGRC-2021-017);农业农村部“甜菜种质资源的收集、鉴定、编目、繁种与入库(圃)保存”(2130135);黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划“甜菜抗旱遗传资源评价及优异基因挖掘”(UNPYSCT-2020014)资助。
年 份:2021
卷 号:43
期 号:4
起止页码:1-8
语 种:中文
收录情况:CAB、普通刊
摘 要:在植物体内,由铵转运蛋白(Ammonium transporters,AMTs)介导植株对铵态氮的吸收和转运。氮素在甜菜糖代谢的过程中起着重要作用,对甜菜AMTs蛋白的功能特性及调控机制进行生物信息学分析对于解析甜菜AMT基因家族的分子功能具有重要意义。本研究通过RT-PCR的方法,在甜菜体内克隆获得了Beta vulgaris ammonium transporter 1-3(BvAMT1-3)基因的全长序列。生物信息学分析结果显示该基因大小为1388 bp,编码462个氨基酸,分子量约为49.729 kDa,亚细胞定位分析其位于内质网膜结构上的可能性较大。系统进化分析显示5个甜菜AMT蛋白序列可分成2个亚族,AMT3亚族仅有1个成员,其余为AMT1亚族成员,同时甜菜BvAMT1-3蛋白与菠菜SoAMT1-3蛋白的亲缘关系最近。5个AMT基因家族成员均由α-螺旋、β-折叠、扩展链以及无规则卷曲4种形式组成。BvAMTs基因家族间的等电点、亲水性、相对分子质量等理化性质存在差异。此外,BvAMT1-3基因的启动子区检测到与植物逆境胁迫、光反应和生长发育相关的顺式作用元件。研究结果可为后续甜菜BvAMT1-3基因在氮胁迫逆境下分子机制的研究提供一定的科学依据。
关 键 词:甜菜 铵转运蛋白 基因 克隆 生物信息学
分 类 号:S566.3]
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