文献类型：期刊文章

作　　者：邢建宏[1] 陈伟[2]

XING Jian-hong;CHEN Wei(School of Resources and Chemical Engineering,Sanming University/Fujian Provincial Key Laboratory of Resources and Environment Monitoring&Sustainable Management and Utilization,Sanming,Fujian 365004,China;School of Life Sciences,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou,Fujian 350002,China)

机构地区：[1]三明学院资源与化工学院/福建省资源环境监测与可持续经营利用重点实验室,福建三明365004 [2]福建农林大学生命科学学院,福建福州350012

出　　处：《宁德师范学院学报（自然科学版）》

基　　金：福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JT180496,B201807);福建省科技厅自然科学基金(2019J01819).

年　　份：2021

卷　　号：33

期　　号：3

起止页码：273-280

语　　种：中文

收录情况：普通刊

摘　　要：为从转录组水平解析秋茄的耐盐机理,分别用不同浓度NaCl处理生长60 d的秋茄幼苗,3 d后收集根系,利用Illumina HiSeq^(TM)2000平台进行转录组测序分析,共得到112 243条Transcripts和61 970条Unigenes,Transcripts与Unigenes的N50分别为2 361和1 510 bp;利用Nr、SwissProt、GO、COG和KEGG数据库对Unigenes基因进行注释,发现有26 804个Unigenes获得注释信息;对获得注释信息的Unigenes基因进行GO、COG和KEGG pathway富集分析发现,与植物抗逆代谢相关的DNA复制、重组和修复,转录与RNA转运剪接,翻译及翻译后修饰、核糖体结构和生物合成,氧化磷酸化以及糖代谢等代谢通路有大量基因富集.研究表明,所建立的秋茄根系盐胁迫转录组数据库包含大量与植物逆境胁迫相关的基因,可作为其耐盐基因差异表达研究的参考数据库.

关 键 词：秋茄 根系 盐胁迫 转录组 RNA测序  

分 类 号：Q945.78[植物生产类]