文献类型：期刊文章

作　　者：黄子粤[1] 刘文君[2] 覃仁柳[1] 庞师婵[1] 肖健[1] 杨尚东[1]

HUANG ZiYue;LIU WenJun;QIN RenLiu;PANG ShiChan;XIAO Jian;YANG ShangDong(Agricultural College of Guangxi University,National Experimental Teaching Demonstration Center of Plant Science,Nanning 530004;Vegetable Research Institute,Guangxi Academy of Agricultural Sciences,Nanning 530007)

机构地区：[1]广西大学农学院/植物科学国家级实验教学示范中心,南宁530004 [2]广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所,南宁530007

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：国家自然科学基金(31860547);广西科技重大专项(桂科AA17202041);广西重点研究计划(桂科AB18216001)。

年　　份：2021

卷　　号：54

期　　号：18

起止页码：4018-4032

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】比较5个不同品种南瓜内生细菌多样性特征并开展基因功能预测分析,为挖掘和利用南瓜内生细菌功能菌株及开拓南瓜辅助育种新方向提供理论依据与参考。【方法】采集5个不同品种南瓜茎部,基于MiSeq高通量测序技术比较分析南瓜茎内生细菌多样性与丰富度,内生细菌门、属分类水平的群落结构组成,以及不同品种南瓜茎内生细菌优势菌群占比。【结果】不同品种南瓜茎部内生细菌多样性与丰富度指数均无显著差异。5个品种南瓜茎内生细菌群落结构由18个门,30个纲,101个目,199个科,362个属,567个种和863个OTU组成,但不同品种南瓜茎中的内生细菌分类阶层总数存在差异。门分类水平,变形菌门(Proteobacteria)细菌是不同品种南瓜茎部的主要优势细菌门类,不同南瓜品种内生细菌群落结构组成相似,但丰度占比不同;属分类水平,假单胞菌属(Pseudomonas)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、剑菌属(Ensifer)、德沃斯氏菌属(Devosia)细菌是不同品种南瓜茎部的主要优势细菌属,优势内生细菌属组成及其丰度随南瓜品种的不同呈现明显差异。杂交品种与父母本品种的门、属分类水平优势内生菌组成及占比均基本相同。PICRUSt分析显示,不同品种南瓜茎部内生细菌主要涉及6个生物代谢通路及46个子功能。不同品种南瓜茎部内生细菌基因二级功能层预测基因种类基本无差异,但基因拷贝数却随着品种不同而异。环境条件是影响南瓜植株内生细菌多样性和丰富度的重要因素;不同品质南瓜植株具有相异的内生细菌群落结构,品质优良南瓜品种具有富集内生细菌的趋势;假单胞菌属(Pseudomonas)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、剑菌属(Ensifer)、德沃斯氏菌属(Devosia)等13个菌属是5个不同品种南瓜茎部的共有优势内生细菌属;而糖霉菌属(Glycomyces)、Candidatus_Rubidus属和Actinokineospora属细菌是品质最优�

关 键 词：南瓜 内生细菌 多样性 MiSeq高通量测序  功能预测  

分 类 号：S642.1]