期刊文章详细信息
MiR-103a-3p与miR-107:骨关节炎进展过程中的潜在生物标志物
MiR-103a-3p and miR-107:potential biomarkers for the progression of osteoarthritis
文献类型:期刊文章
Yang Mingyi;Su Yani;Xu Ke;Peng Kan;Yirixiati Aihaiti;Zheng Haishi;Yang Yanni;Cai Yongsong;Xu Peng(Department of Clinical Medicine,Medical School of Yan'an University,Shaanxi 716000,China;Department of Osteonecrosis and Joint Recon-struction,Honghui Hospital,Xi'an Jiaotong University,Xi'an 710054,China;Department of Traditional Chinese and Western Medicine,First Department of Clinical Medicine,Shaanxi University of Chinese Medicine,Xianyang 712046,China)
机构地区:[1]延安大学医学院临床医学系,716000 [2]西安交通大学附属红会医院骨坏死与关节重建科,710054 [3]陕西中医药大学第一临床医学院中西医结合医学系,咸阳712046
基 金:国家自然科学基金(81772410);中国博士后科学基金(2020M673454);陕西省自然科学基础研究基金(2021JQ-924)。
年 份:2021
卷 号:25
期 号:9
起止页码:616-621
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的探讨OA发病机制中潜在的Hub基因、关键miRNAs、生物过程及相关信号通路,为OA的发病机制及治疗提供生物信息学依据。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载OA滑膜组织样本的表达谱芯片,鉴定差异表达基因DEGs,并进行功能富集分析。构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),STRING和Cytoscape进行模块分析,进一步鉴定Hub基因,并对Hub基因进行更深一步的miRNAs挖掘。结果最终鉴定出与OA进展相关的9个Hub基因[细胞因子信号转导抑制因子(SOCS)3、转导素重复序列包含蛋白(BTRC)、F-框蛋白32(FBXO32)、KLHL22、UBE3A、HUWE1、UBR4、ANAPC5、TRIM50]和2个关键miRNAs(hsa-miR-103a-3P、hsa-miR-107),可能是OA发病机制中的潜在生物标志物。信号转导、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控和蛋白丝氨酸/苏氨酸酶活性与OA的发病机制具有一定的相关性。此外,分析结果表明cAMP信号通路和Rap1信号通路也参与了OA的进展。结论潜在生物学分子、生物过程及相关通路对于OA的病因研究及治疗研究具有重要的指导意义。
关 键 词:骨关节炎 基因 微RNAS 生物标志物
分 类 号:R684.3]
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