文献类型：期刊文章

作　　者：陈可[1,2] 李翠翠[1,2] 李博[1,2,3]

CHEN Ke;LI Cuicui;LI Bo(Department of Pharmaceutical Analysis,China Pharmaceutical University,Nanjing 211198;Key Laboratory of Protein Chemistry and Structural Biology,China Pharmaceutical University,Nanjing 211198;Innovative Drug Research Institute,China Pharmaceutical University,Hangzhou 310018,China)

机构地区：[1]中国药科大学药物分析系,南京211198 [2]中国药科大学,蛋白质化学与结构生物学重点实验室,南京211198 [3]中国药科大学(杭州)创新药物研究院,杭州310018

出　　处：《中国药科大学学报》

年　　份：2021

卷　　号：52

期　　号：4

起止页码：422-430

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：基于串联质谱的蛋白质组学分析方法往往依赖于实际谱图和理论谱图的匹配打分,而大量共洗脱肽的干扰会降低多肽和蛋白的鉴定及定量的准确性。多肽保留时间预测可将多肽色谱保留行为转变为稳定独立的特征时间属性,作为多肽鉴定的辅助和验证指标,改善多肽鉴定的准确性。复杂体系中多肽色谱保留预测也对优化蛋白质组学测定条件、提高数据非依赖采集中质谱数据的检出率和重复性具有重要意义。本文针对未修饰多肽及修饰多肽常用的色谱保留预测方法(包括基于标准化索引、多肽分子模型、氨基酸残基参数和机器学习等)进行了综述,总结各种方法的原理及其特点,并对其在蛋白质组学中的应用及发展方向进行了展望。

关 键 词：多肽保留时间预测  多肽保留时间  数据非依赖采集  蛋白质组学

分 类 号：R917]