文献类型：期刊文章

作　　者：任晨霞[1] 武翠玲[1] 韩鹏勇[1]

REN Chen-Xia;WU Cui-Ling;HAN Peng-Yong(Central Laboratory,Changzhi Medical College,Changzhi 046000,China)

机构地区：[1]长治医学院中心实验室,长治046000

出　　处：《中国免疫学杂志》

基　　金：国家自然科学基金(31900038);长治医学院博士启动基金(BS201922)项目。

年　　份：2021

卷　　号：37

期　　号：10

起止页码：1201-1209

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的:通过生物信息学方法分析脂多糖结合蛋白(LBP)在胃癌组织中的表达及意义。方法:从Ualcan数据库获取正常胃组织及胃癌组织LBP表达数据,利用GEPIA数据库分析LBP表达与胃癌患者预后的关系,在LinkedOmics中检索LBP在胃癌中的共表达基因,通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能。最后利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。结果:与正常胃组织相比,Ⅰ和Ⅲ分期、老年和男性患者胃癌组织中LBP表达水平均明显升高,但与幽门螺杆菌感染与否无显著相关性。在胃癌中与LBP共表达的基因主要涉及急性炎症反应、激活蛋白级联、蛋白质-脂质复合物亚基组织等生物学过程,介导货物受体活性、脂多糖结合、蛋白质-脂质复合物的绑定、糖胺聚糖绑定等分子功能,富集于血液微粒、蛋白质-脂质复合物、内质网腔等细胞组分。富集的KEGG信号通路主要与补体和凝血级联、胆固醇代谢、PPAR信号等通路相关。LBP高表达患者的总生存率和无病生存率明显低于LBP低表达患者。LBP蛋白与TLR4、STAT3、IL-6、STAT6、IL-4、IL-10、JAK1、JAK2、JAK3、SOCS3等存在互作关系。结论:LBP在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为胃癌筛选、预后预测的标志物之一。

关 键 词：胃癌 脂多糖结合蛋白 生物信息学分析 共表达分析  

分 类 号：R735.2]