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期刊文章详细信息

毛重楼叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析    

Complete chloroplast genome of Paris mairei:characterization and phylogeny

  

文献类型:期刊文章

作  者:江媛[1,2] 杨青淑[1,2] 王婧[1,2] 杨成金[3] 黄林芳[2] 杨燕[4] 段宝忠[1]

JIANG Yuan;YANG Qing-shu;WANG Jing;YANG Cheng-jin;HUANG Lin-fang;YANG Yan;DUAN Bao-zhong(College of Pharmaceutical Science,Dali University,Dali 671000,China;Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical College,Beijing100193,China;Yunnan Baiyao Group Traditional Chinese Medicine Resources Co.,Ltd.,Kunming 650504,China;Yunnan Provincial Academy of Science and Technology,Kunming 650051,China)

机构地区:[1]大理大学药学院,云南大理671000 [2]中国医学科学院药用植物研究所,北京100193 [3]云南白药集团中药资源有限公司,云南昆明650504 [4]云南省科学技术院,云南昆明650051

出  处:《中草药》

基  金:国家自然科学基金项目(31860080);云南省重大科技专项(202002AA100007);大理大学创新团队项目(ZKLX2019318);云南省院士专家工作站(宋经元,2021-1)。

年  份:2021

卷  号:52

期  号:13

起止页码:4014-4022

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的获取毛重楼Paris mairei叶绿体基因组信息特征并对其系统位置进行研究。方法采用Illumination测序技术对毛重楼叶绿体基因组进行测序,对其进行组装、注释和特征分析,并构建最大似然(maximum likelihood,ML)系统发育树。结果毛重楼叶绿体基因组大小为163918 bp,总GC含量为37.05%,大单拷贝区(large single-copy,LSC)、小单拷贝区(small single-copy region,SSC)分别为84173、13054 bp,反向互补重复区(inverted repeats,IR)大小为33296 bp,共编码113个基因,包括79个蛋白质编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。在系统进化树中,重楼属Paris L.与藜芦科(Melanthiaceae Batsch ex Borkh.)关系较近,与百合科(Liliaceae Juss.)关系较远。结论LSC区和SSC区序列变异高于IR区;相较于重楼属,毛重楼与蚤休组的亲缘关系最近,应将毛重楼归属为蚤休组;相较于百合科,毛重楼与藜芦科藜芦属亲缘关系更近,应将蚤休组从百合科中独立,归属为藜芦科。

关 键 词:毛重楼  叶绿体基因组 重楼属 系统发育 藜芦科  

分 类 号:R282[中药学类]

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同被引文献:

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