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期刊文章详细信息

基于二代测序技术的浙江畲族线粒体DNA多态性    

Mitochondrial DNA Polymorphism in Zhejiang She Population Based on Next Generation Sequencing

  

文献类型:期刊文章

作  者:杨琪[1,2] 张静怡[2,3] 张晓春[1,2] 夏若成[2,4] 于欢[1,2] 屈轶龄[1,2] 王紫薇[1,2] 谭睿[1,2] 张素华[2] 李成涛[1,2] 高玉振[1]

YANG Qi;ZHANG Jing-yi;ZHANG Xiao-chun;XIA Ruo-cheng;YU Huan;QU Yi-ling;WANGZi-wei;TAN Rui;ZHANG Su-hua;LI Cheng-tao;GAO Yu-zhen(Department of Forensic Medicine,Medical College of Soochow University,Suzhou 215123,China;Shang-hai Key Laboratory of Forensic Medicine,Key Laboratory of Forensic Science,Ministry of Justice,Shang-hai Forensic Service Platform,Academy of Forensic Science,Shanghai 200063,China;Laboratory of Ob-stetrics and Gynecology,the Affiliated Luoyang Central Hospital,Zhengzhou University,Luoyang 471000,Henan Province,China;Department of Forensic Medicine,School of Basic Medical Sciences,Wenzhou Medical University,Wenzhou 325035,Zhejiang Province,China)

机构地区:[1]苏州大学医学部法医学系,江苏苏州215123 [2]司法鉴定科学研究院,上海市法医学重点实验室,司法部司法鉴定重点实验室,上海市司法鉴定专业技术服务平台,上海200063 [3]郑州大学附属洛阳中心医院妇产医学实验室,河南洛阳471000 [4]温州医科大学基础医学院法医学系,浙江温州325035

出  处:《法医学杂志》

基  金:上海市科学技术委员会社会发展领域计划项目(18DZ1200300);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助项目(GY2020D-2);司法部司法鉴定重点实验室资助项目;上海市法医学重点实验室资助项目(17DZ2273200);上海市司法鉴定专业技术服务平台资助项目(19DZ2292700)。

年  份:2021

卷  号:37

期  号:3

起止页码:358-365

语  种:中文

收录情况:CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的研究线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)全基因组在浙江畲族的遗传多态性,探究畲族的母系遗传结构。方法对浙江畲族231名无关个体进行mtDNA全基因组测序,统计变异位点信息及单倍型多样性(haplotype diversity,HD)、个体识别率(discrimination power,DP)、随机匹配概率(random match probabilities,RMP)等群体遗传学参数。对浙江畲族样本mtDNA进行单倍群划分,并与中国其他9个群体进行母系遗传关系比较。结果在231例浙江畲族样本中共检测到8507个变异位点(702种),可划分为94个单倍群。HD、DP和RMP分别为0.9986、0.9942和0.0058。浙江畲族与南方汉族群体之间的遗传分化程度最小(Fst=0.00689),主成分分析及中介网络分析表明浙江畲族虽与广西瑶族、云南傣族、南方汉族遗传距离较近,但亦具有相对独特的遗传特征。结论mtDNA全基因组在浙江畲族中具有良好的遗传多态性,浙江畲族的遗传组分较为复杂多元,与广西瑶族、云南傣族、南方汉族的母系遗传关系较近,同时也保留了其独特的母系遗传成分。

关 键 词:法医遗传学 多态现象,遗传  二代测序  线粒体DNA 畲族

分 类 号:DF795.2[法医学类]

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