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芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)PHB基因的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of PHB Gene in Brassica Species(B.napus,B.rapa,B.oleracea)
文献类型:期刊文章
Wang Han;Yan Min;Xu Ye;Wang Renlei;Liu Shaohua(Jiangsu Key Laboratory for Biofunctional Molecules,College of Life Science and Chemistry,Jiangsu Second Normal University,Nanjing,211200)
机构地区:[1]江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏省生物功能分子重点建设实验室,南京211200
基 金:江苏省自然科学基金资助项目(BK20170756);国家自然科学基金项目(31700280);江苏省高等学校自然科学基金项目(17KJB180002)共同资助。
年 份:2021
卷 号:19
期 号:13
起止页码:4232-4241
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:HD-ZIPⅢ基因家族参与植物胚胎发生、分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等过程。本研究利用生物信息学方法,对HD-ZIPⅢ成员之一PHABULOSA(PHB)进行鉴定,在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝中共获得7个PHB成员,并对其核苷酸和氨基酸序列的基本特征、结构域、保守基序、基因结构和系统进化关系进行了分析。结果表明,这些PHB蛋白编码不稳定的亲水性蛋白,所有成员均含有Homeobox、bZIP、START和MEKHLA保守结构域,PHB位点在三个物种间的进化符合禹氏三角理论。序列分析及测序结果显示白菜的两个PHB基因在miR165、miR166结合位点处存在一个碱基差异。本研究为进一步揭示芸薹属物种PHB基因功能提供了依据。
关 键 词:芸薹属 PHB miR165 miR166 生物信息学
分 类 号:Q943.2[植物生产类]
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引证文献:
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