文献类型：期刊文章

作　　者：温东旭[1] 陈建春[1] 王一飞[1] 徐业芬[1] 索朗斯珠[1] 牛家强[1] 赵霞玲[1,2]

WEN Dong-xu;CHEN Jian-chun;WANG Yi-fen;XU Ye-fen;SUOLANG Si-zhu;NIU Jia-qiang;ZHAO Xia-ling(Protincial Key Laboratory of Tibet Plateau Animal Epidemic Disease Research/Department of Animal Science,Tibet Agriculture&Animal Husbandry Collge,Linzhi 860000,China;Institute of Veterinary Medicine,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210095,China)

机构地区：[1]西藏农牧学院动物科学学院西藏高原动物疫病研究自治区高校重点实验室,西藏林芝860000 [2]江苏省农业科学院兽医研究所,南京210095

出　　处：《中国兽医科学》

基　　金：西藏自治区科技厅2019年重点项目;西藏农牧学院研究生创新计划项目(YJS2020-15);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)。

年　　份：2021

卷　　号：51

期　　号：7

起止页码：898-907

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为了筛选牦牛MBL2基因3′-UTR区与抗菌有关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),本研究通过扩增青藏高原521头牦牛血液中MBL2基因3′-UTR区,并分别进行测序,利用DNAMAN8.0、CHROMAS 2.6.6和Haploview软件对序列进行SNPs预测和连锁不平衡分析,使用ELISA检测试剂盒分别检测血清中多杀巴氏杆菌和布氏杆菌抗体D450值,利用SPSS分析SNPs与多杀性巴氏杆菌和布氏杆菌血清抗体D450值的相关性,并通过miRWalk和RNA 22数据库对靶向牦牛MBL2基因3′-UTR区的miRNAs进行预测筛选。结果显示,牦牛MBL2基因3′-UTR区SNP大小为861 bp,预测存在A997C、T1295C、A1473T、C1511T和C1540T共5个SNPs,其中A997C和T1295C、A1473T和C1540T位点强连锁不平衡,A997C/T1295C位点CC/CC基因型与多杀性巴氏杆菌抗体D450值的相关性显著高于AA/TT基因型和AC/TC基因型(P<0.05);共预测到223个靶向牦牛MBL2基因3′-UTR区的miRNAs,其中12个miRNAs分别靶向T1295C、A1473T、C1511T和C1540T位点。结论,牦牛MBL2基因3′-UTR区A997C/T1295C位点多态性可能与牦牛抗多杀性巴氏杆菌性状具有相关性,12个miRNAs可能通过靶向T1295C、A1473T、C1511T和C1540T位点参与牦牛MBL表达水平调节。

关 键 词：牦牛 MBL2  单核苷酸多态性(SNP)  多杀性巴氏杆菌 布氏杆菌 miRNA  

分 类 号：S852.659.5]