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牛轮状病毒NSP5基因SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
Establishment and application of SYBR Green Ⅰ real-time RT-PCR for detecting NSP5 gene of bovine rotavirus
文献类型:期刊文章
YU De-bin;CAO Cun;XU Xiao-jing;YU Li;CHANG Ji-tao(Division of Livestock Infections Disease,State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology,Harbin Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150069,China;Research and Development Department,Harbin Veken Biotechnology Co.,Ltd.,Harbin 150069,China;College of Veterinary Medicine,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010010,China)
机构地区:[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/牛羊传染病研究创新团队,黑龙江哈尔滨150069 [2]哈尔滨维科生物技术有限公司研发部,黑龙江哈尔滨150069 [3]内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特010010
基 金:内蒙古自治区科技重大专项“牛腹泻疾病防控关键技术与标准化操作规程示范推广”(2020ZD0006)。
年 份:2021
卷 号:43
期 号:4
起止页码:399-404
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为建立检测牛轮状病毒(BRV)快速特异的荧光定量RT-PCR方法,本研究针对BRV NSP5基因设计了一对特异性引物经PCR扩增目的片段,并克隆于pCI载体作为重组质粒标准品(pCI-NSP5),经优化反应条件,建立了基于NSP5基因的BRV荧光定量RT-PCR方法,并对其进行了特异性、敏感性及重复性试验。结果显示,建立的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法最佳引物浓度为10μmol/L,模板为2μL,退火温度为58℃;特异性试验结果显示,该方法除对BRV的检测结果为阳性外,对牛病毒性腹泻病毒、牛冠状病毒、牛副流感3型病毒、牛呼吸道合胞体病毒的检测结果均为阴性;敏感性试验结果显示,该方法对重组质粒标准品的最低检测限为12拷贝/μL,对BRV的最低检测限为1×102TCID50/反应;批内和批间重复性试验的变异系数均小于2%。利用该方法检测30份BRV接种犊牛的粪便样品,结果 25份呈阳性,而利用VP7基因的常规RT-PCR和病毒分离方法检出的阳性样品分别为20份和25份,表明本研究建立的检测方法的敏感性高于VP7基因的常规RT-PCR方法,而与病毒分离方法的符合率为100%。以上结果表明,本研究建立的BRV NSP5基因荧光定量RT-PCR检测方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,可以用于BRV的快速检测、病原流行病学调查以及疫苗免疫攻毒试验的病毒载量定量等研究。
关 键 词:牛轮状病毒 NSP5基因 荧光定量RT-PCR
分 类 号:S852.65]
参考文献:
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