文献类型：期刊文章

作　　者：黄晓慧[1,2] 王炜莹[1,2] 王倩[1,2] 吴燕雨[1,2] 张娟[1,2]

HUANG Xiao-hui;WANG Wei-ying;WANG Qian;WU Yan-yu;ZHANG Juan(Hunan Provincial Key Laboratory of Tumor Microenvironment Responsive Drug Research,School of Pharmacy,University of South China,Heng yang,Hunan,China 421001;Hunan Provincial Center for Collaborative Innovation in Research on Molecularly Targeted Drugs)

机构地区：[1]南华大学药学院药学系,肿瘤微环境响应与药物研究湖南省重点实验室,湖南衡阳421001 [2]湖南省分子靶标新药研究协同创新中心

出　　处：《中国病原生物学杂志》

基　　金：湖南省教育厅科学研究项目(No.19C1578);大学生研究性学习和创新性实验计划项目(No.X202010555401)。

年　　份：2021

卷　　号：16

期　　号：6

起止页码：639-643

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的运用生物信息学软件预测生殖支原体P110蛋白的结构和功能。方法从NCBI数据库中下载P110的氨基酸序列,通过ProtParam和ProtScale在线工具对蛋白的理化性质、亲疏水性质进行分析;利用SignalP-5.0和TMpred及Phobius分析该蛋白的信号肽和跨膜蛋白结构域;利用NetNGlyc 1.0 Server和NetPhos 3.1 Server软件预测蛋白质糖基化位点和磷酸化位点;采用在线软件SOPMA分析蛋白的二级结构,利用SWISS-MODEL软件建立蛋白的三级结构模型;利用ABCpred和SYF-PEITHI Hla-a*0201预测蛋白的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位;使用STRING在线软件及NCBI中的BLAST工具对相互作用蛋白进行分析。结果P110蛋白的相对分子质量为114.44782×10_(3),由1053个氨基酸组成,理论等电点为7.6,分子式为C_(5095)H_(7952)N_(1354)O_(1624)S_(9),为稳定的亲水性蛋白。该蛋白含有跨膜结构域且有信号肽,可能属于分泌蛋白。该蛋白含有12个糖基化位点和153个磷酸化位点,二级结构预测主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,分别占24.41%和45.77%。P110蛋白含有94个B细胞抗原表位和23个T细胞抗原表位,该蛋白P110可能与MGPA、HMW2和P32等10个蛋白存在相互作用关系。结论生殖支原体P110蛋白为亲水性分泌蛋白,具有潜在的B/T细胞抗原表位,可作为研发新型靶向药物的候选蛋白。

关 键 词：生殖支原体 P110  生物信息学 结构  功能  

分 类 号：R375]