文献类型：期刊文章

作　　者：翟新国[1] 周琼琼[2] 郑培培[3] 李庆阳[4] 陈小霞[1] 陈琦[2] 石德时[2] 李朋辉[1]

ZHAI Xinguo;ZHOU Qiongqiong;ZHENG Peipei;LI Qingyang;CHEN Xiaoxia;CHEN Qi;SHI Deshi;LI Penghui(College of Life Sciences and Food Engineering,Hebei University of Engineering,Handan 056038,China;College of Veterinary Medicine/State Key Laboratory of Agricultural Microbiology,Huazhong Agriculture University,Wuhan 430070,China;Personnel Department,Hebei University of Engineering,Handan 056038,China;Hebei Dabeinong Fanning and Animal Husbandry Food Co.,Ltd.,Hengshui 053900,China)

机构地区：[1]河北工程大学生命科学与食品工程学院,河北邯郸056038 [2]华中农业大学动物医学院/农业微生物学国家重点实验室,武汉430070 [3]河北工程大学人事处,河北邯郸056038 [4]河北大北农农牧食品有限公司,河北衡水053900

出　　处：《黑龙江畜牧兽医》

基　　金：河北工程大学创新基金-博士专项基金项目“河北省猪场主要病毒性传染病的流行病调查”。

年　　份：2021

期　　号：12

起止页码：56-62

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、RCCSE、核心刊

摘　　要：为了解近年来河北地区猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)的流行性和遗传变异性,试验采集河北省某发病猪场仔猪的小肠组织,提取RNA,对S1基因进行RT-PCR,对扩增的阳性产物进行克隆与测序,对测序结果进行同源性分析,对S1蛋白进行亲水性、表面可触性、抗原指标及T细胞基序分析,利用MEGA X 10.0.5软件对PEDV S1基因进行最大似然法(maximum likelihood, ML)遗传进化分析,利用RDP4软件进行PEDV S1基因的重组分析。结果表明:成功克隆出pMD18-T-PEDV-S1,将该毒株命名为HB/HS/2019株,其包含N末端域和C末端域的S1基因近全长序列,长度为2 163 bp,编码721个氨基酸;成功预测S1潜在的B细胞表位和T细胞基序。经同源性分析,HB/HS/2019与四川株CH/SCJY/2018 S1基因的相似性最高,为99.8%;与比利时CV777毒株的基因相似性为91.4%,存在插入和缺失现象。经进化分析,40株PEDV分为GⅠ群和GⅡ群,HB/HS/2019属于GⅡ群。在GⅡ群内,我国流行株均为2010年后出现,HB/HS/2019与市售疫苗株AJ1102和LW/L亲缘关系较近,与CV777和attenuated CV777株亲缘关系较远。经重组分析,未发现HB/HS/2019 S1序列含有潜在的重组事件,发现GⅠ群和GⅡ群的毒株之间S1基因存在3个重组事件。说明HB/HS/2019 S1基因与2010年以后我国报道的变异毒株亲缘关系较近,虽然该基因存在一些核酸位点变异,但是尚未发生基因重组事件。

关 键 词：河北省  猪流行性腹泻病毒 S1基因 遗传变异  重组分析  

分 类 号：S852.65] Q78[动物医学类]