文献类型：期刊文章

作　　者：王茹[1,2] 柯岩[3] 韦荣飞[2] 王新禹[2] 李栋[2,4]

WANG Ru;KE Yan;WEI Rong-Fei;WANG Xin-Yu;LI Dong(Division of Life Sciences and Medicine,University of Science and Technology of China,Hefei 230027,China;National Laboratory of Biomacromolecules,CAS Center for Excellence in Biomacromolecules,Institute of Biophysics,Chinese Academy of Sciences,Beijing100101,China;Arthritis Clinic and Research Center,Peking University Peopleʼs Hospital,Beijing 100044,China;College of Life Sciences,University of Chinese Academy of Sciences,Beijing100049,China)

机构地区：[1]中国科学技术大学生命科学与医学部生命科学学院,合肥230027 [2]中国科学院生物物理研究所,中国科学院科教融合生物大分子卓越创新中心,生物大分子国家重点实验室,北京100101 [3]北京大学人民医院骨关节科,北京100044 [4]中国科学院大学生命科学学院,北京100049

出　　处：《生物化学与生物物理进展》

基　　金：国家自然科学基金(31771440,31770930)资助项目。

年　　份：2021

卷　　号：48

期　　号：6

起止页码：667-676

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、RCCSE、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：RBM15是一种RNA结合蛋白,参与到RNA的m6A修饰及可变剪接调控中.然而,RBM15在转录组水平如何调控可变剪接尚不清楚.本研究应用超分辨率荧光显微镜技术发现,RBM15在细胞核中形成斑点状结构,且与核斑有密切接触或完全定位于核斑中.核斑为细胞核中无膜细胞器,富含多种剪接因子,这提示RBM15可能参与到可变剪接的调控过程中.为了确定RBM15能否及如何调控可变剪接,我们利用siRNA敲低RBM15,并对敲低RBM15和野生型细胞进行二代测序.结果显示,敲低RBM15能够引起1111个转录本中的1279个可变剪接事件的变化.与已发表的RBM15-CLIP数据进行比较分析,我们发现,这1111个转录本中,有191个能够与RBM15结合,提示这191个转录本可能为RBM15调控的直接靶标.进一步的分析表明,RBM15结合能够促进这191个转录本中的121个发生内含子或外显子的滞留.该研究揭示了RBM15在转录组水平调控可变剪接的规律.

关 键 词：RBM15  可变剪接 核斑  

分 类 号：Q7] Q219