文献类型：期刊文章

作　　者：刘变枝[1] 李海洁[1] 郭家鸿[1] 郭朝辉[1] 冯建新[2] 杨雪冰[3] 张娇[1] 李明[1]

LIU Bianzhi;LI Haijie;GUO Jiahong;GUO Chaohui;FENG Jianxin;YANG Xuebing;ZHANG Jiao;LI Ming(College of Animal Science and Technology, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450046, China;Laboratory of Aquaculture and Genetic Breeding, Henan Academy of Fishery Science, Zhengzhou 450044, China;Henan Fishery Technical Extensive Station, Zhengzhou 450008, China)

机构地区：[1]河南农业大学动物科技学院,河南郑州450046 [2]河南省水产科学研究院水产养殖与遗传育种研究室,河南郑州450044 [3]河南省水产技术推广站,河南郑州450008

出　　处：《河南农业大学学报》

基　　金：国家自然科学基金项目(31702359);河南省科技攻关项目(172102110047);河南农业大学科技创新基金项目(KJCX2017A07)。

年　　份：2021

卷　　号：55

期　　号：3

起止页码：468-476

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：以鲤肾脏组织RNA为模板,扩增并克隆鲤环指蛋白2(RING Finger Protein 2,RNF2)基因的CDS区全长,分析其组织表达谱。结果显示,鲤RNF2基因的CDS区序列长1011 bp,编码336个氨基酸;该基因与鲫、斑马鱼、金头鲷、海洋青鳉鱼、鳕鱼、非洲爪蟾、尖尾娇鹟、小鼠、智人的同源性分别为98.2%、93.1%、78.0%、79.2%、79.2%、73.9%、78.1%、72.7%、72.7%;理化性质分析表明,RNF2蛋白分子质量为37.44 kD,理论等电点(pI)为6.28,脂肪系数为74.97%,不稳定指数为36.75,无跨膜结构和信号肽;亚细胞定位预测分析表明,该蛋白定位于细胞核(52.2%)、线粒体(26.1%)、细胞质(17.4%)和过氧化物酶体(4.3%)。蛋白质结构域分析表明该蛋白含RING结构域和RAWUL结构域,且RING结构域与斑马鱼、小鼠和智人完全一致;二级结构和三级结构表明,鲤鱼RNF2蛋白含有α-螺旋(35.12%)、延伸链(8.63%)、β-转角(0.89%)和无规则卷曲(55.36%);泛素化底物预测显示,TP53、IRF4、HIST2H2AC、H3F3B和HIST3H3作为RNF2蛋白的底物具有较高的置信度;实时荧光定量PCR结果显示,鲤RNF2基因在肌肉中表达量最高,其次是头肾和肝脏,在肾脏中表达量最低。这些结果为进一步研究RNF2在鲤鱼抗病毒应答中的作用提供了基础信息。

关 键 词：鲤  RNF2基因  克隆鉴定 生物信息学分析 组织表达  

分 类 号：S917[水产类]