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我国HIV-1 CRF55_01B感染者抗病毒治疗前耐药分析    

Analysis on drug resistance in people infected with HIV-1 CRF55_01B before antiviral therapy in China

  

文献类型:期刊文章

作  者:郑姗[1] 宋畅[1] 甘梦泽[1] 韩晴羽[1] 胡婧[1] 董敖渤[1] 廖玲洁[1] 冯毅[1] 阮玉华[1] 邢辉[1]

Zheng Shan;Song Chang;Gan Mengze;Han Qingyu;Hu Jing;Dong Aobo;Liao Lingjie;Feng Yi;Ruan Yuhua;Xing Hui(State Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control,National Center for AIDS/STD Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China)

机构地区:[1]中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室,北京102206

出  处:《中华实验和临床病毒学杂志》

基  金:国家科技重大专项(2017ZX10201101);国家自然科学基金(81471962,81261120393)。

年  份:2021

卷  号:35

期  号:2

起止页码:194-198

语  种:中文

收录情况:CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的了解我国HIV-1 CRF5501B感染者抗病毒治疗前对蛋白酶类抑制剂(PI)、核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)、整合酶抑制剂(INSTIs)的耐药程度以及耐药株的传播关系。方法对2018年全国抗病毒治疗前HIV耐药监测中CRF5501B重组亚型感染者的血浆样本提取RNA,分别扩增蛋白酶/逆转录酶(PR/RT)区基因片段1 056 bp和整合酶(IN)区基因片段846 bp并测序,利用美国斯坦福大学HIV db Program数据库中全部收录药物进行耐药判定,运用HIV-TRACE软件进行HIV-1耐药传播网络分析,并重点分析了CRF5501B整合酶基因区遗传多态性位点的突变情况。结果共分析来自全国26个省的178份样本,获得CRF5501B PR/RT区序列170条以及对应样本的IN区序列170条,总体耐药率为15.3%(26/170)。PIs、NRTIs、NNRTIs、INSTIs耐药率分别为1.2%(2/170)、1.2%(2/170)、15.3%(26/170)、0.6%(1/170);耐药水平多为低度耐药,NNRTIs类耐药位点主要是V179D/E与其他位点协同出现,另有84.1%(143/170)单独携带V179D/E的感染者表现为潜在耐药;INSTIs类耐药位点为G163R,对EVG和RAL表现为低度耐药。在0.9% 最适基因距离阈值下构建分子网络,入网率为30.0%(51/170),耐药株在男男同性传播人群和异性性传播人群之间传播,并且都携带耐药位点E138G和V179E。在整合酶区CRF5501B与CRF01AE和B亚型在5个位点突变频率差异较高(T215A、G134N、I135V)。结论我国CRF5501B感染者抗病毒治疗前即对NNRTIs类药物耐药率较高,携带E138G和V179E耐药位点的毒株存在成簇传播,CRF5501B整合酶抑制剂耐药株处于低水平流行,但整合酶基因区存在的高突变率的遗传性多态性位点对药物敏感性有潜在的影响,所以新型重组毒株耐药对我国抗病毒治疗的影响还需要进一步监测和分析。

关 键 词:CRF5501B  抗病毒治疗前  耐药位点  整合酶基因区  遗传多态性

分 类 号:R512.91]

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