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基于网络药理学与分子对接探讨黄芪治疗溃疡性结肠炎的作用机制
Study on the Mechanism of Astragali Radix in the Treatment of Ulcerative Colitis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
文献类型:期刊文章
HAO Minqi;WANG Jiahui;LI Xiaoling;LI Hailong;WU Yuhong(School of Basic Medicine,Gansu University of TCM,Lanzhou 730000,China;Key Laboratory of Dunhuang Medicine and Its Transformation of Ministry of Education,Gansu University of TCM,Lanzhou 730000,China;Key Laboratory of TCM Mining and Innovation Transformation,Gansu University of TCM,Lanzhou 730000,China;First Clinical Medicial School,Gansu University of Chinese Medicine,Lanzhou,730000,China)
机构地区:[1]甘肃中医药大学基础医学院,兰州730000 [2]甘肃中医药大学敦煌医学与转化教育部重点实验室,兰州730000 [3]甘肃中医药大学中医方药挖掘与创新转化重点实验室,兰州730000 [4]甘肃中医药大学第一临床医学院,兰州730000
基 金:国家自然科学基金资助项目(No.81860810);国家中医药管理局第四批全国中医基础优秀人才研修项目(No.国中医药人教发〔2017〕24号);2018年甘肃省中医药管理局科研项目(No.GZK-2018-5);敦煌医学与转化教育部重点实验室2018年度开放基金项目(No.DHYX18-17);甘肃中医药大学科学研究与创新基金项目(No.2019KCZD-5)。
年 份:2021
卷 号:32
期 号:10
起止页码:1215-1223
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:预测黄芪对溃疡性结肠炎(UC)的可能作用靶点与机制,为临床应用黄芪治疗UC的后续研究提供参考。方法:经中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)和UniProt KB数据库检索黄芪的活性成分及其对应靶点基因,经Gene Cards数据库检索UC疾病相关靶点基因,借助Venny 2.1.0在线作图工具获取黄芪与UC的交集靶点基因,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“药物-化合物-交集靶点”相互作用网络。利用STRING数据库获取交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络,并应用Cytoscape 3.7.0软件进行可视化分析和拓扑学分析以获取核心靶点基因。借助DAVID数据库对交集靶点基因进行基因本体(GO)功能注释及KEGG通路富集,并应用Cytoscape 3.7.0软件构建“靶点-通路”富集网络。通过AutoDock vina 1.1.2软件将度值排名前5位的活性成分与核心靶点基因编码蛋白进行分子对接,应用Discovery Studio 3.5软件绘制结合模式图。结果:黄芪中共有化合物143个,共筛选出了活性成分20个,对应的靶点基因189个;UC疾病相关靶点基因共4356个。黄芪(涉及14种活性成分)与UC的交集靶点基因有126个。PPI网络中的核心靶点基因为AKT1、MAPK1、RB1、JUN等。GO功能注释共得到GO条目2294个(q值<0.05),包括生物过程条目2093个(如对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应等)、细胞组成条目49个(如膜筏、膜微区等)、分子功能条目152个(如核受体活性、配体激活的转录等)。KEGG通路富集分析共得到条目160个(q值<0.05),如流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、白细胞介素17(IL-17)信号通路等。分子对接结果显示,度值排名前5位的活性成分(槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素、异鼠李素、7-O-methylisomucronulatol)与核心靶点编码蛋白的结合能均小于-5.0 kcal/mol。结论:黄芪中的槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素异等活性成�
关 键 词:黄芪 活性成分 溃疡性结肠炎 网络药理学 分子对接 作用机制
分 类 号:R285[中药学类] R574.1[中医学类]
参考文献:
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