文献类型：期刊文章

作　　者：樊晓静[1] 于文涛[1] 蔡春平[2] 林浥[1] 王泽涵[1] 房婉萍[3] 张见明[4] 叶乃兴[1]

FAN XiaoJing;YU WenTao;CAI ChunPing;LIN Yi;WANG ZeHan;FANG WanPing;ZHANG JianMing;YE NaiXing(College of Horticulture,Fujian Agriculture and Forestry University/Key Laboratory of Tea Science in Universities of Fujian Province,Fuzhou 350002;Technology Centre of Fuzhou Customs District/Fujian Key Laboratory for Technology Research of Inspection and Quarantine,Fuzhou 350001;College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095;Wuyi University,Wuyishan 354300,Fujian)

机构地区：[1]福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福州350002 [2]福州海关技术中心/福建省检验检疫技术研究重点实验室,福州350001 [3]南京农业大学园艺学院,南京210095 [4]武夷学院科研处,福建武夷山354300

出　　处：《中国农业科学》

基　　金：福建省“2011协同创新中心”中国乌龙茶产业协同创新中心专项(闽教科〔2015〕75号);海关总署科技项目(2020HK187);福建农林大学茶产业链科技创新与服务体系建设项目(2020-01);福建张天福茶叶发展基金会科技创新基金(FJZTF01)。

年　　份：2021

卷　　号：54

期　　号：8

起止页码：1751-1760

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EAPJ2020、GEOBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】建立茶树品种的SNP分子标记数据库,结合茶树品种基本信息,将SNP位点组成的DNA指纹图谱构建28位数字组成的茶树品种资源分子身份证,便于茶树品种资源的保护与精准管理,避免“同名异物、同物异名”的现象。【方法】通过挖掘茶树的表达序列标签,获得大量的高质量表达序列标签,将其进行装配后,开发候选位点,将候选位点与茶树全基因组进行BLAST,得到其在全基因组染色体上的位置与具体关联基因。以铁观音、福鼎大白茶、龙井43、云抗10号等103份国内外不同类型的茶树品种资源为供试材料,提取基因组DNA,利用预扩增技术和微流体芯片法对供试茶树品种资源进行SNP基因分型,获得SNP位点数据及候选SNP位点的信息指数、观测杂合度、期望杂合度等信息,将多态性从高到低进行排序,进行SNP位点组合筛选,得到最优SNP位点组合后,结合茶树品种基本信息构建茶树品种资源分子身份证。【结果】从茶树的表达序列标签数据库中挖掘出1786个候选SNP位点。根据序列保守性,筛选出96个SNP标记位点,与最新茶树基因组比对发现候选位点较均匀地分布于茶树全基因组的15条染色体上;对茶树品种资源的候选SNP位点的多态性信息进行分析,剔除10个不具多态性的位点,剩余86个位点的信息指数平均值为0.517,观测杂合度平均值为0.370,期望杂合度平均值为0.346,固定指数平均值为-0.036,次等位基因频率平均值为0.269。从86个SNP位点中筛选出24个多态性高的SNP位点,组成DNA指纹图谱,可区分出全部参试茶树品种资源。对24个SNP位点组成的DNA指纹图谱并结合茶树品种资源基本信息进行数字编码,最终形成由28位数字组成的茶树品种资源分子身份证。【结论】依据SNP标记的多态性信息,筛选SNP位点,精准区分全部供试茶树品种,并将24个SNP位点所构建的茶树品种资源DNA指纹图谱及品�

关 键 词：茶树 品种资源 SNP 分子身份证 DNA指纹图谱

分 类 号：S571.1]