期刊文章详细信息
基于转录组学和蛋白质组学分析小檗碱抗糖尿病慢性炎症机制
The anti-diabetic chronic inflammation mechanism of berberine based on transcriptomics and proteomics analysis
文献类型:期刊文章
CAO Ying-qian;ZHOU Li-fen;YU Hong;XUE Ya-nan;AI Zhi-fu;ILUXiao-quan;ZHANG Chang-hua(School of Pharmacy,Jiangxi University of Traditional Chinese Medicine,Nanchang 330004,China;Large Precision Instrument Sharing Serice Center of Jiangxi University of Traditional Chinese Medicine,Nanchang 330004,China;School of Mathematics and Computer,Yuzhang Normal Universiry,Nanchang 330004,China;Experimental Animal Science and T'echnology Center of Jiangxi Universily of Traditional Chinese Medicine,Nanchang 330004,China)
机构地区:[1]江西中医药大学药学院,南昌330004 [2]江西中医药大学大型精密仪器共享服务中心,南昌330004 [3]豫章师范学院数学与计算机学院,南昌330004 [4]江西中医药大学实验动物科技中心,南昌330004
基 金:国家自然科学基金(81774194);江西省自然科学重点项目联合资助基金(20192ACBL20027);江西省自然科学基金(20202BABL206142);江西省教育厅科技计划重点项目(GJJ190636);江西省中药学一流学科专项科研基金项目(JXSYLXK-ZHYAO118)。
年 份:2021
卷 号:30
期 号:5
起止页码:424-433
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、EMBASE、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:通过LPS诱导的RAW264.7细胞炎症模型,应用转录组学和蛋白质组学技术探究小檗碱抗糖尿病慢性炎症机制。方法:RAW264.7细胞通过LPS(0.1μg·mL^(-1))诱导,给予小檗碱(1μg·mL^(-1)),分别提取蛋白和RNA,进行蛋白质组学和转录组学分析,分别找出差异表达蛋白和差异表达基因,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并运用STRING进行绘制相互作用图(PPI),对共同差异表达蛋白和基因进行实时荧光定量PCR进行验证。结果:通过模型组与小檗碱组相比较,转录组学共有1801个差异表达基因,找出11种差异表达基因Pdia4,Itgam,Hsp90b1,Prdx5,Pdia6,Myc,Fosl1,Il10,Ccl2,Lpin2,Pik3r2与炎症相关;蛋白质组学共得到83个差异表达蛋白,找出10个差异表达蛋白Hsp90b1,Pdia6,Prdx5,Pdia4,Itgam,Stat1,Pgm2,Ptgs1,Nos2,Actb与炎症相关;共同差异表达蛋白和基因共有5个。结论:小檗碱可能是通过减少炎症因子释放,同时减少Hsp90b1,Pdia6,Prdx5,Pdia4,Itgam,PTGS1,NOS2和IL^(-1)0及增加Pik3r2和LPIN 2基因的生成来达到抗炎作用,进一步缓解异常代谢和胰岛素抵抗以及减轻内质网氧化损伤来治疗糖尿病。
关 键 词:转录组学 蛋白质组学 小檗碱 RAW264.7细胞 糖尿病 抗炎
分 类 号:R96] R977.15[药学类]
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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