文献类型：期刊文章

作　　者：封志炜[1] 李虎玲[2] 王小燕[2] 马金凤[3] 王凯[4]

FENG Zhiwei;LI Huling;WANG Xiaoyan;MA Jinfeng;WANG Kai(Basic Medical College,Xinjiang Medical University,Urumqi 830011,China;College of Public Health,Xinjiang Medical University,Urumqi 830011,China;Students Affairs Division,Xinjiang Medical University,Urumqi 830011,China;College of Medical Engineering and Technology,Xinjiang Medical University,Urumqi 830011,China)

机构地区：[1]新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐830011 [2]新疆医科大学公共卫生学院,乌鲁木齐830011 [3]新疆医科大学学生处,乌鲁木齐830011 [4]新疆医科大学医学工程技术学院,乌鲁木齐830011

出　　处：《新疆医科大学学报》

基　　金：新疆维吾尔自治区创新环境(人才、基地)建设专项项目(2020D14020)。

年　　份：2021

卷　　号：44

期　　号：4

起止页码：427-434

语　　种：中文

收录情况：CAB、CAS、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的利用肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中的食管癌样本数据,应用生物信息学分析方法构建基于mRNA、lncRNA、miRNA的预后风险评分系统,为食管癌的预后、治疗决策提供理论依据。方法下载TCGA数据库中食管癌mRNA、lncRNA、miRNA和临床病理数据,应用拉索(least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)回归、单变量和多变量Cox回归确定一组与食管癌预后相关的RNA并建立食管癌的预后风险评分。利用RNA预后风险评分和临床病理特征构建列线图模型,通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve, AUC)和决策曲线分析法(decision curve analysis, DCA)对列线图和肿瘤分期(tumor node metastasis, TNM)模型的优劣进行评估,并使用bootstrap重抽样对列线图模型进行内部验证。结果经过筛选共得到12个与预后相关的RNA,包括SLC26A9、COX6B2、RP13-672B3.2、RXFP3、OSM,5个mRNA;BLACAT1、CTD-2034I21.2、RP11-60A24.3、RP11-1123I8.1, 4个lncRNA;hsamir-1269a、hsa-mir-135b、hsa-mir-935, 3个miRNA。模型评估显示,基于TNM分期模型的AUC为0.653,RNA预后风险评分和TNM分期联合的列线图模型的AUC为0.815,后者显示出良好的区分能力。DCA显示列线图模型的临床净收益比单纯的TNM分期模型高,且内部验证结果显示列线图模型预测值和实际值具有良好的一致性。结论基于12个RNA的预后风险评分具有良好的区分能力,有助于食管癌的临床治疗和预后决策。

关 键 词：食管癌 MRNA lncRNA  MIRNA 预后模型

分 类 号：R735.1]