文献类型：期刊文章

作　　者：邹智[1] 赵永国[2] 张丽[3] 孔华[1] 郭运玲[1] 郭安平[1]

ZOU Zhi;ZHAO Yong-guo;ZHANG Li;KONG Hua;GUO Yun-ling;GUO An-ping(Hainan Key Laboratory for Biosafety Monitoring and Molecular Breeding in Off-Season Reproduction Regions,In-stitute of Tropical Bioscience and Biotechnology,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Haikou 571101,China;Guangdong University of Petrochemical Technology,Maoming 525000,China;College of Life Science,South-Central University for Nationalities,Hubei Provincial Key Laboratory for Protection and Application of Special Plants in Wuling Area of China,Wuhan 430074,China)

机构地区：[1]中国热带农业科学院热带生物技术研究所/海南省南繁生物安全与分子育种重点实验室,海南海口571101 [2]广东石油化工学院生物与食品工程学院,广东茂名525000 [3]中南民族大学生命科学学院/武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室,湖北武汉430074

出　　处：《中国油料作物学报》

基　　金：海南省自然科学基金(320RC705和319MS093);中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630052017011);国家自然科学基金(31700580和31971688);2018年度广东省普通高校特色创新项目(2018KTSCX148)。

年　　份：2021

卷　　号：43

期　　号：2

起止页码：229-235

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：油莎豆以其适应性广、产量和含油量高而成为我国的新型油料作物。为解析油莎豆的遗传基础,服务于育种和分子生物学研究,采用单分子实时测序技术构建了油莎豆高质量的全长转录组,混合样本的组织来源包括块茎、匍匐茎、根、芽、叶片、叶鞘、花、花茎等。研究基于23.20 Gb高质量的原始数据提取获得环形一致序列319568条,其平均长度和测序深度分别为2101 bp和43×;通过聚类、校正和去冗余最终得到高质量的序列57849条,合计121.79 Mb;转录组的完整性约为79.58%,其中约有76.20%的为全长转录本;通过比对NR、Swissprot、GO、KOG、eggNOG、Pfam、KEGG等数据库,共获得52424条序列的注释信息,注释比例约为90.62%;此外,研究还预测获得3759条lncRNA、43060个SSR位点以及2300条转录因子序列。这些结果不仅增加了我们对油莎豆遗传特性的认知,同时还为下一步开展基因表达谱分析、功能基因的挖掘与利用等奠定了坚实的基础。

关 键 词：油莎豆 油料作物 全长转录组  单分子实时测序  

分 类 号：S565.9]