文献类型：期刊文章

作　　者：孙昊[1] 宋雅君[1] 郑杨洋[1] 刘郁涛[2] 任薇[2] 万雪花[2]

SUN Hao;SONG Ya-Jun;ZHENG Yang-Yang;LIU Yu-Tao;REN Wei;WAN Xue-Hua(Collge of Life Sciences,Nankai Universily,Tianjin 300071,China;TEDA Institute of Biological Sctences and Biotechnology,Nankai University,Tianjin 300457,Chuna)

机构地区：[1]南开大学生命科学学院,天津300071 [2]南开大学泰达生物技术研究院,天津300457

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》

基　　金：南开大学中央高校基本科研基金(No.63191440)资助。

年　　份：2021

卷　　号：37

期　　号：1

起止页码：118-126

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、PUBMED、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：细菌非编码RNA(ncRNAs)是细菌生长和感染过程中至关重要的转录调控因子,对致病菌快速响应环境变化,调整自身基因表达抵御环境胁迫尤为重要。本研究通过对新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218的高通量转录物组测序,发现新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218(NMEC)表达丰富的ncRNAs。经生物信息学分析,在新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218中,共发现45个潜在的ncRNAs。通过与非致病性大肠杆菌K-12基因组比对,发现新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218基因组有300个大于100 bp的特异性序列。结合分析获得的非编码RNA,发现共有9个ncRNAs是新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218特异的。随机选择Nsr21,用小鼠尾静脉注射模型验证其作用,发现与野生型RS218对照组相比,注射Δnsr21的小鼠血液中的含菌量显著增加(P<0.01)。说明缺失Nsr21后,更有利于新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218在小鼠血液内生存和繁殖。通过qRT-PCR检测Nsr21表达发现,与体外培养环境相比,小鼠血液环境中Nsr21的表达显著下调(P<0.001)。说明新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218,是通过下调Nsr21的表达使其更有利于在血液中生存和繁殖。本研究提示,新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218基因组中包含大量的ncRNA,这些ncRNA可能与调控NMEC致病性相关。NMEC在感染血液过程中,通过下调Nsr21的表达使NMEC在血液中的繁殖能力增加。

关 键 词：非编码RNA 新生儿脑膜炎大肠杆菌K1 RS218(NMEC)  转录物组  

分 类 号：Q93-3]