文献类型：期刊文章

作　　者：韩利红[1] 田雪莲[1] 李雪梅[1] 谭娟[1] 何春萍[1] 刘潮[1]

HAN Lihong;TIAN Xuelian;LI Xuemei;TAN Juan;HE Chunping;LIU Chao(College of Biological Resource and Food Engineering,Yunnan Engineering Research Center of Fruit Wine,Qujing Normal University,Qujing 655011,Yunnan,China)

机构地区：[1]曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心,云南曲靖655011

出　　处：《食用菌学报》

基　　金：国家自然科学基金(31860005、32060710);云南省地方本科高校基础研究联合专项(202001BA070001-002)。

年　　份：2021

卷　　号：28

期　　号：2

起止页码：26-35

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD_E2021_2022、JST、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：以蛹虫草(Cordyceps militaris)核基因组和线粒体基因组数据为基础,对密码子使用偏性及其影响因素进行分析。结果显示:蛹虫草核基因的GC含量为59.53%,同义密码子第3位胞嘧啶频率最高(50.58%),高表达基因的平均有效密码子数较低;核基因中共鉴定出22个高频密码子,均以G/C结尾,其中16个为最优密码子,且81.25%的最优密码子以C结尾;基因表达与有效密码子数、第3位同义密码子C的频率显著相关;核基因密码子偏性较强,低表达基因主要受碱基突变影响,而高表达基因主要受选择压力影响。线粒体基因的GC含量为24.52%,高频密码子主要以A/T结尾,密码子偏性受到碱基突变和选择压力影响;功能基因在蛹虫草生长发育过程中发挥基础作用,影响密码子使用偏性的因素可能与核基因一致。与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)相比,蛹虫草基因密码子使用偏性更接近大肠杆菌(Escherichia coli)。研究结果为蛹虫草基因分子进化、功能基因研究和资源开发利用提供参考。

关 键 词：蛹虫草 食药用真菌  核基因组 线粒体基因组 密码子偏性 最优密码子  进化压力  

分 类 号：S567.3]