文献类型：期刊文章

作　　者：王一鹤[1] 王焱[1] 底斐瑶[2] 底泽亚[3] 席镤[4] 文一博[1] 冶卓[1] 任川川[1] 文建国[1]

WANG Yihe;WANG Yan;DI Feiyao;DI Zeya;XI Pu;WEN Yibo;YE Zhuo;REN Chuanchuan;WEN Jianguo(Urodynamic Center,First Affiliated Hospital of Zhengzhou University,Zhengzhou 450052;Department of Obstetrics and Gynecology,First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University,Chongqing 400016;School of Oectmoics Engineering and Computer Science,Peking University,Beijing 100871;Department of Thyroid Surgery,First Affiliated Hospital of Zhengzhou University,Zhengzhou 450052,China)

机构地区：[1]郑州大学第一附属医院尿动力中心,河南郑州450052 [2]重庆医科大学妇产科,重庆400016 [3]北京大学信息科学技术学院,北京100871 [4]郑州大学第一附属医院甲状腺外科,河南郑州450052

出　　处：《细胞与分子免疫学杂志》

基　　金：国家自然科学基金(81670689);国家自然科学基金重点联合项目(U1904208)。

年　　份：2021

卷　　号：37

期　　号：2

起止页码：113-118

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的探讨前列腺癌(PCa)组织中免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)临床意义,为治疗PCa提供参考。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载PCa转录数据与临床数据,获取PCa中lncRNA;再下载与免疫相关的基因集;对获取的免疫基因与lncRNA采用Pearson相关性分析法进行共表达以确定与免疫相关的lncRNA,再通过单因素Cox回归和Lasso回归确定关键的lncRNA;采用R软件中的"ggplot package"和"survival package"分析这些lncRNA与临床特征的相关性与预后价值。我们使用lnc2RNA数据库分析lncRNA在正常前列腺组织与PCa组织之间的表达差异。最后使用Starbase、David在线网站确定有预后价值的lncRNA的靶基因和靶基因的富集分析。结果AL162586.1、AC138028.4、SLC25A25-AS1、AC002553.1、AC004816.1、LINC00641、AC027796.4是免疫相关且关键的lncRNA,其表达量随着N等级的升高而升高;AL162586.1和SLC25A25-AS1表达量随着T等级升高而升高。SLC25A25-AS1和LINC00641在肿瘤组织中和正常组织中表达量有差异。基因本体论(GO)富集结果显示SLC25A25-AS1主要分布于细胞膜、通过剪接体对mRNA剪接进行负调控,并与核苷酸结合;在KEGG富集中主要富集在剪接体通路。结论lncRNA已成为PCa新的研究方向,其中SLC25A25-AS1可能是通过剪接途径影响PCa患者预后。

关 键 词：长链非编码RNA(lncRNA)  癌症基因组图谱(TCGA)  前列腺癌 免疫

分 类 号：R737.25] R392.11[临床医学类]